Répertoire du corps professoral

Phage therapy against Staphylococcus hyicus a neglected swine pathogen
Programme: The Canadian Wide Bacteriophage Therapy Acceleration Fund
Organisme(s) subventionnaire(s): Université de Toronto
Type de financement: Subvention
Établissement tête: Université Laval
Du 1 août 2024 au 31 juillet 2026

Évaluation de l'efficacité des cocktails de bactériophages contre la furonculose (1er volet)
Programme: Subventions Alliance
Organisme(s) subventionnaire(s): Association des Aquaculteurs du Québec, Conseil de recherches en sciences naturelles et génie Canada, Ministère de l'agriculture, des pêcheries et de l'alimentation
Type de financement: Subvention
Établissement tête: Université Laval
Du 15 juin 2024 au 14 juin 2026

Évaluation de l'impact des pratiques de gestion du sevrage, de la manipulation et du transport des porcelets sevrés à différents âges…
Programme: Accélération-Élévation
Organisme(s) subventionnaire(s): MITACS Inc.
Type de financement: Subvention
Établissement tête: Université Laval
Du 1 juin 2024 au 31 mai 2028

Modification du microbiome des truies pour favoriser la productivité, la santé et les performances des porcelets
Programme: Accélération-Élévation
Organisme(s) subventionnaire(s): MITACS Inc.
Type de financement: Subvention
Établissement tête: Université Laval
Du 1 juin 2024 au 31 mai 2027

Qualité et innocuité de la viande de porc du Québec : approches métatranscriptomiques, génomiques et conventionnelles
Programme: Subventions Alliance
Organisme(s) subventionnaire(s): Olymel, Sani-Marc inc., Consortium de recherche et innovations en bioprocédés industriels au Québec, Conseil de recherches en sciences naturelles et génie Canada, Porcima inc.
Type de financement: Subvention
Établissement tête: Université Laval
Du 30 avril 2024 au 29 avril 2027

Caractérisation microbiologique et génomique de souches québécoises d’Aeromonas salmonicida
Programme: Projet subsidiaire d'un regroupement stratégique
Organisme(s) subventionnaire(s): Fonds de recherche du Québec - Nature et technologies
Type de financement: Subvention
Établissement tête: Université du Québec à Rimouski - UQAR
Du 29 avril 2024 au 31 mars 2025

Assessing the impact of weaning management pratices, handling and transport
Programme: Programme Agri-siences
Organisme(s) subventionnaire(s): Conseil canadien du porc
Type de financement: Subvention
Établissement tête: Université Laval
Du 1 avril 2024 au 31 mars 2028

Transfert de connaissances (Démonstration des capacités d’antibioremédiation des moulées d’élevage par les larves de mouches soldats noires)
Programme: Programme Innovation bioalimentaire 2023-2028 - Volet 2 - Recherche appliquée, développement expérimental et adaptation technologique
Organisme(s) subventionnaire(s): Ministère de l'agriculture, des pêcheries et de l'alimentation
Type de financement: Subvention
Établissement tête: Université Laval
Du 18 mars 2024 au 31 mars 2028

Démonstration des capacités d’antibioremédiation des moulées d’élevage par les larves de mouches soldats noires
Programme: Programme Innovation bioalimentaire 2023-2028 - Volet 2 - Recherche appliquée, développement expérimental et adaptation technologique
Organisme(s) subventionnaire(s): Ministère de l'agriculture, des pêcheries et de l'alimentation
Type de financement: Subvention
Établissement tête: Université Laval
Du 18 mars 2024 au 30 avril 2027

Transfert de connaissances (La programmation précoce du microbiote intestinal chez le poulet de chair dans une optique d'amélioration de la santé intestinale et de réduction de l'utilisation des antimicrobiens à titre préventif)
Programme: Programme Innovation bioalimentaire 2023-2028 - Volet 2 - Recherche appliquée, développement expérimental et adaptation technologique
Organisme(s) subventionnaire(s): Ministère de l'agriculture, des pêcheries et de l'alimentation
Type de financement: Subvention
Établissement tête: Université Laval
Du 18 mars 2024 au 31 mars 2027

La programmation précoce du microbiote intestinal chez le poulet de chair dans une optique d'amélioration de la santé intestinale et de réduction de l'utilisation des antimicrobiens à titre préventif
Programme: Programme Innovation bioalimentaire 2023-2028 - Volet 2 - Recherche appliquée, développement expérimental et adaptation technologique
Organisme(s) subventionnaire(s): Ministère de l'agriculture, des pêcheries et de l'alimentation
Type de financement: Subvention
Établissement tête: Université Laval
Du 18 mars 2024 au 30 avril 2026

Recherche sur la diversité et l'évolution de la bactérie Brochothrix thermosphacta
Programme: Programme NOVA- FRQNT-CRSNG pour chercheurs et chercheuses de la relève
Organisme(s) subventionnaire(s): Conseil de recherches en sciences naturelles et génie Canada, Fonds de recherche du Québec - Nature et technologies
Type de financement: Subvention
Établissement tête: Université Laval
Du 15 mars 2024 au 15 mars 2027

Altering sow microbiome to promote sow productivity and health and performances of piglets
Programme: Programme Agri-siences
Organisme(s) subventionnaire(s): Conseil canadien du porc
Type de financement: Subvention
Établissement tête: Université Laval
Du 1 avril 2023 au 31 mars 2028

Combattre la furonculose chez le saumon atlantique par l'utilisation de cocktails de bactériophages
Programme: Programme Samuel-De Champlain
Organisme(s) subventionnaire(s): Fonds de recherche du Québec - Nature et technologies
Type de financement: Subvention
Établissement tête: Université Laval
Du 1 avril 2023 au 31 mars 2025

Vitamin D supplementation to improve laying hen robustness, longevity, and egg quality
Programme: Subventions Alliance du CRSNG-Accélération de Mitacs
Organisme(s) subventionnaire(s): Fédération des producteurs d'oeufs du Québec, DSM Nutritional Products Canada Inc., Conseil de recherches en sciences naturelles et génie Canada, MITACS Inc., Les Producteurs d'œufs du Canada
Type de financement: Subvention
Établissement tête: Université Laval
Du 16 janvier 2023 au 15 janvier 2026

Centre de Recherche en Infectiologie Porcine et Avicole
Programme: Regroupements stratégiques NT
Organisme(s) subventionnaire(s): Université Laval - Fonds internes, Fonds de recherche du Québec - Nature et technologies
Type de financement: Subvention
Établissement tête: Université de Montréal
Du 1 avril 2022 au 31 mars 2028

Development of strategies to mitigate antibiotic resistance in swine
Programme: Subventions à la découverte SD (individuelles et d'équipe)
Organisme(s) subventionnaire(s): Conseil de recherches en sciences naturelles et génie Canada
Type de financement: Subvention
Établissement tête: Université Laval
Du 1 avril 2022 au 31 mars 2027

Development of strategies to mitigate antibiotic resistance in swine
Programme: Supplément Tremplin vers la découverte
Organisme(s) subventionnaire(s): Conseil de recherches en sciences naturelles et génie Canada
Type de financement: Subvention
Établissement tête: Université Laval
Du 1 avril 2022 au 31 mars 2027

Ressources Aquatiques Québec
Programme: Regroupements stratégiques NT
Organisme(s) subventionnaire(s): Université Laval - Fonds internes, Fonds de recherche du Québec - Nature et technologies
Type de financement: Subvention
Établissement tête: Université du Québec à Rimouski - UQAR
Du 1 avril 2019 au 31 mars 2026

Financements des 2 dernières années

Étude de la diversité génomique des souches de Staphylococcus hyicus au Québec, un agent pathogène affectant les porcelets
Programme: Projet subsidiaire d'un regroupement stratégique
Organisme(s) subventionnaire(s): Fonds de recherche du Québec - Nature et technologies
Type de financement: Subvention
Établissement tête: Université de Montréal
Du 6 avril 2023 au 1 mars 2024

Développement d’une approche MALDI-TOF à haut-débit pour l’identification et la caractérisation des Carnobactéries
Programme: Projet subsidiaire d'un regroupement stratégique
Organisme(s) subventionnaire(s): Fonds de recherche du Québec - Nature et technologies
Type de financement: Subvention
Établissement tête: Université Laval
Du 19 décembre 2022 au 31 mars 2024

Alimentation des porcelets en post-sevrage dans un contexte de réduction des apports en zinc.
Programme: Innov'Action volet 1
Organisme(s) subventionnaire(s): Olymel, Ministère de l'agriculture, des pêcheries et de l'alimentation, Groupe Cérès inc., Probiotech Inc., Agri-Marché, Trouw Nutrition Canada
Type de financement: Subvention
Établissement tête: Université Laval
Du 7 mars 2022 au 30 avril 2024

Élaboration de moyens microbiologiques écoresponsables novateurs pour une utilisation moindre des antibiotiques en élevage de poulets de chair
Programme: Programme Innov’Action agroalimentaire
Organisme(s) subventionnaire(s): Ministère de l'agriculture, des pêcheries et de l'alimentation
Type de financement: Subvention
Établissement tête: Université Laval
Du 1 avril 2021 au 31 mars 2024

Le seigle comme ingrédient pour améliorer le bien-être et la santé des truies et des porcelets
Programme: Programme Innov’Action agroalimentaire
Organisme(s) subventionnaire(s): Ministère de l'agriculture, des pêcheries et de l'alimentation, KWS Lochow GMBH
Type de financement: Subvention
Établissement tête: Université Laval
Du 1 février 2021 au 31 mars 2024

Alex-An Gilbert, Maîtrise en sciences animales - avec mémoire

Encadrements terminés dans les 5 dernières années

Sarah Girard, Maîtrise en microbiologie - avec mémoire

Vincent Gélinas, Maîtrise en microbiologie - avec mémoire

Xavier Monger, Maîtrise en sciences animales - avec mémoire

Pascal Laforge, Maîtrise en sciences des aliments - microbiologie alimentaire - avec mémoire

Sophie Gosselin, Maîtrise en sciences animales - avec mémoire

Amal Touahri, Maîtrise en sciences animales - avec mémoire

Publications des 5 dernières années

Resilience of Loin Meat Microbiota and of Resistance Genes to a Chlortetracycline Treatment in Weaned Piglets Antibiotics, 2024/10. Xavier C. Monger, Linda Saucier, Alex-An Gilbert, Sophie Gosselin, Éric Pouliot, Sylvain Fournaise, Antony Vincent. DOI 10.3390/antibiotics13100997

Genomic Characterization of a Tetracycline-Resistant Strain of <i>Brochothrix thermosphacta</i> Highlights Plasmids Partially Shared between Various Strains Genes, 2023/08. Antony Vincent, Romain P. Bergeron, Laurie C. Piché, David Prado, Linda Saucier. DOI 10.3390/genes14091731

Assessment of Antifungal/Anti-Oomycete Activity of Frass Derived from Black Soldier Fly Larvae to Control Plant Pathogens in Horticulture: Involvement of <i>Bacillus velezensis</i> Sustainability, 2023/07. Ghazaleh Arabzadeh, Maxime Delisle-Houde, Grant W. Vandenberg, Nicolas Derome, Marie-Hélène Deschamps, Martine Dorais, Antony Vincent, Russell J. Tweddell. DOI 10.3390/su151410957

Studying the Association between Antibiotic Resistance Genes and Insertion Sequences in Metagenomes: Challenges and Pitfalls Antibiotics, 2023/01. Lucie Galiot, Xavier C. Monger, Antony Vincent. DOI 10.3390/antibiotics12010175

Host Dependent-Transposon for a Plasmid Found in <i>Aeromonas salmonicida </i>subsp. <i>salmonicida </i>That Bears a <i>catB3</i> Gene for Chloramphenicol Resistance Antibiotics, 2023/01. Pierre-Étienne Marcoux, Sabrina A. Attéré, Valérie E. Paquet, Maude F. Paquet, Sarah B. Girard, Judith Farley, Michel Frenette, Antony Vincent, Steve J. Charette. DOI 10.3390/antibiotics12020257

Expansion of the pRAS3 Plasmid Family in <i>Aeromonas salmonicida</i> subsp. <i>salmonicida</i> and Growing Evidence of Interspecies Connections for These Plasmids Antibiotics, 2022/08. Kim C. Fournier, Valérie E. Paquet, Sabrina A. Attéré, Judith Farley, Hélène Marquis, Hubert Gantelet, Christian Ravaille, Antony Vincent, Steve J. Charette. DOI 10.3390/antibiotics11081047

To Be or Not to Be Mesophilic, That Is the Question for <i>Aeromonas salmonicida</i> Microorganisms, 2022/01. Antony Vincent, Steve J. Charette. DOI 10.3390/microorganisms10020240

Sodium tetraphenylborate displays selective bactericidal activity against Neisseria meningitidis and N. gonorrhoeae and is effective at reducing bacterial infection load Antimicrobial Agents and Chemotherapy, 2021. Bernet, E., Lebughe, M., Vincent, A.T., Haghdoost, M.M., Golbaghi, G., Laplante, S., Castonguay, A., Veyrier, F.J.. DOI 10.1128/AAC.00254-20

Characterization of bacteriophage T7-Ah reveals its lytic activity against a subset of both mesophilic and psychrophilic Aeromonas salmonicida strains Archives of Virology, 2021. Leduc, G.R., Paquet, V.E., Vincent, A.T., Charette, S.J.. DOI 10.1007/s00705-020-04923-w

AsaGEI2d: a new variant of a genomic island identified in a group of Aeromonas salmonicida subsp. salmonicida isolated from France, which bears the pAsa7 plasmid FEMS microbiology letters, 2021. Vincent, A.T., Intertaglia, L., Loyer, V., Paquet, V.E., Adouane, É., Martin, P., Bérard, C., Lami, R., Charette, S.J.. DOI 10.1093/femsle/fnab021

4-Methylcytosine DNA modification is critical for global epigenetic regulation and virulence in the human pathogen Leptospira interrogans Nucleic Acids Research, 2021. Gaultney, R.A., Vincent, A.T., Lorioux, C., Coppeé, J.-Y., Sismeiro, O., Varet, H., Legendre, R., Cockram, C.A., Veyrier, F.J., Picardeau, M.. DOI 10.1093/nar/gkaa966

Systematic Analysis of the Stress-Induced Genomic Instability of Type Three Secretion System in <i>Aeromonas salmonicida</i> subsp. <i>salmonicida</i> Microorganisms, 2020/12. Pierre-Étienne Marcoux, Antony Vincent, Marie-Ange Massicotte, Valérie E. Paquet, Émilie J. Doucet, Nava Hosseini, Mélanie V. Trudel, Gabriel Byatt, Mathilde Laurent, Michel Frenette, Steve J. Charette. DOI 10.3390/microorganisms9010085

The Aeromonas salmonicida plasmidome: a model of modular evolution and genetic diversity Annals of the New York Academy of Sciences, 2020/10/10. Antony T. Vincent, Nava Hosseini, Steve J. Charette. DOI 10.1111/nyas.14503

The complete plastome of the coccoid green alga Jenufa minuta (Chlorophyceae, incertae sedis) unveils a noncanonical genetic code and a previously unrecognized trans-spliced group II intron in the rpl32 gene Mitochondrial DNA Part B: Resources, 2020. Turmel, M., Vincent, A.T., Otis, C., Lemieux, C.. DOI 10.1080/23802359.2020.1749165

The complete mitogenomes of the green algae Jenufa minuta and Jenufa perforata (Chlorophyceae, incertae sedis) reveal a variant genetic code previously unrecognized in the Chlorophyceae Mitochondrial DNA Part B: Resources, 2020. Turmel, M., Otis, C., Vincent, A.T., Lemieux, C.. DOI 10.1080/23802359.2020.1742229

RskA Is a Dual Function Activator-Inhibitor That Controls SigK Activity Across Distinct Bacterial Genera Frontiers in Microbiology, 2020. Veyrier, F.J., Nieves, C., Lefrancois, L.H., Trigui, H., Vincent, A.T., Behr, M.A.. DOI 10.3389/fmicb.2020.558166

Qu’est-ce que le génome de SARS-CoV-2 nous apprend sur son origine et le développement de traitements potentiels ? Seminar at the Department of Fondamental Sciences, 2020.

Mécanismes d'adaptation des microorganismes aux animaux d'élevage Seminar at CRIPA, 2020.

La microbiologie au service des animaux d’élevage Seminar at the Department of Animal Sciences at Laval University, 2020.

Genome sequencing and functional characterization of a Dictyopanus pusillus fungal enzymatic extract offers a promising alternative for lignocellulose pretreatment of oil palm residues PLoS ONE, 2020. Rueda, A.M., de los Santos, Y.L., Vincent, A.T., Létourneau, M., Hernández, I., Sánchez, C.I., Daniel Molina, V., Ospina, S.A., Veyrier, F.J., Doucet, N.. DOI 10.1371/journal.pone.0227529

D’un hôte à l’autre : un choix ou une contrainte ? Seminar at the Department of Microbiology, Infectiology and Immunology at Montreal University, 2020.

Complete genome sequences for two Myoviridae strains infecting cyanobacteria in a subarctic lake Microbiology Resource Announcements, 2020. Lévesque, A.V., Thaler, M., Labrie, S.J., Marois, C., Vincent, A.T., Lapointe, A.-M., Culley, A.. DOI 10.1128/MRA.01339-19

CAPRIB: a user-friendly tool to study amino acid changes and selection for the exploration of intra-genus evolution BMC Genomics, 2020. Guerra Maldonado, J.F., Vincent, A.T., Chenal, M., Veyrier, F.J.. DOI 10.1186/s12864-020-07232-3

Would Bacteriophages Be a New Old Complement to Antibiotics in Aquaculture? Microbial Communities in Aquaculture Ecosystems, 2019/06/08. DOI 10.1007/978-3-030-16190-3_3

The Rise and Fall of Antibiotics in Aquaculture Microbial Communities in Aquaculture Ecosystems, 2019/06/08. DOI 10.1007/978-3-030-16190-3_1

Étude de la diversité insoupçonnée de la bactérie Leptospira sp. 4e édition du congrès de Bactériologie intégrative: Symbiose et Pathogènese (BiSP), 2019.

Unmasking key regulators in bacterial host-tropism 4e édition du congrès de Bactériologie intégrative: Symbiose et Pathogenèse (BiSP), 2019.

The Pseudomonas aeruginosa Pan-Genome Provides New Insights on Its Population Structure, Horizontal Gene Transfer, and Pathogenicity Genome Biology and Evolution, 2019. Freschi, L., Vincent, A.T., Jeukens, J., Emond-Rheault, J.-G., Kukavica-Ibrulj, I., Dupont, M.-J., Charette, S.J., Boyle, B., Levesque, R.C.. DOI 10.1093/gbe/evy259

Systems and evolutionary biology of the Pseudomonas aeruginosa population structure 69th annual conference of the Canadian society of microbiologist, 2019.

Rôle des toxines Stx dans la réponse d’Escherichia coli entérohémorragique O157:H7 à l’irradiation 4e édition du congrès de Bactériologie intégrative: Symbiose et Pathogenèse (BiSP), 2019.

Revisiting the taxonomy and evolution of pathogenicity of the genus Leptospira through the prism of genomics PLoS Neglected Tropical Diseases, 2019. Vincent, A.T., Schiettekatte, O., Goarant, C., Neela, V.K., Bernet, E., Thibeaux, R., Ismail, N., Khalid, M.K.N.M., Amran, F., Masuzawa, T., Nakao, R., Korba, A.A., Bourhy, P., Veyrier, F.J., Picardeau, M.. DOI 10.1371/journal.pntd.0007270

Regulation of waah by phob during pi starvation promotes biofilm formation by Escherichia coli o157:h7 8th ASM Conference on Biofilms, 2019. DOI 10.1128/JB.00093-19

Rapid multicellular cell shape evolution: lesson form Neisseriaceae family 4e édition du congrès de Bactériologie intégrative: Symbiose et Pathogenèse (BiSP), 2019.

Rapid multicellular cell shape evolution: lesson form Neisseriaceae family 69th annual conference of the Canadian society of microbiologist, 2019.

Portrait of blood-derived extracellular vesicles in patients with Parkinson's disease Neurobiology of Disease, 2019. Lamontagne-Proulx, J., St-Amour, I., Labib, R., Pilon, J., Denis, H.L., Cloutier, N., Roux-Dalvai, F., Vincent, A.T., Mason, S.L., Williams-Gray, C., Duchez, A.-C., Droit, A., Lacroix, S., Dupré, N., Langlois, M., Chouinard, S., Panisset, M., Barker, R.A., Boilard, E., Cicchetti, F.. DOI 10.1016/j.nbd.2018.11.002

Platelet abnormalities in Huntington's disease Journal of Neurology, Neurosurgery and Psychiatry, 2019. Denis, H.L., Lamontagne-Proulx, J., St-Amour, I., Mason, S.L., Rowley, J.W., Cloutier, N., Tremblay, M.-E., Vincent, A.T., Gould, P.V., Chouinard, S., Weyrich, A.S., Rondina, M.T., Barker, R.A., Boilard, E., Cicchetti, F.. DOI 10.1136/jnnp-2018-318854

Pan-génome de Pseudomonas aeruginosa : structure de population, le transfert horizontal des gènes et pathogénicité 4e Congrès de Bactériologie intégrative : Symbiose & Pathogenèse (BiSP), 2019.

One Aeromonas salmonicida subsp. salmonicida isolate with a pAsa5 variant bearing antibiotic resistance and a pRAS3 variant making a link with a swine pathogen Science of the Total Environment, 2019. Massicotte, M.-A., Vincent, A.T., Schneider, A., Paquet, V.E., Frenette, M., Charette, S.J.. DOI 10.1016/j.scitotenv.2019.06.456

One Aeromonas salmonicida ssp. salmonicida isolate with two unusual plasmids causing antibiotic resistance 8th congress of European Microbiologist, 2019.

L’importance du séquençage à longues lectures pour la caractérisation de génomes complexes tel que celui de l’agent pathogène Aeromonas salmonicida ssp. salmonicida 4ieme édition du du congrès de Bactériologie intégrative: Symbiose et Pathogenèse (BiSP), 2019.

Investigation of the virulence and genomics of Aeromonas salmonicida strains isolated from human patients Infection, Genetics and Evolution, 2019. Vincent, A.T., Fernández-Bravo, A., Sanchis, M., Mayayo, E., Figueras, M.J., Charette, S.J.. DOI 10.1016/j.meegid.2018.11.019

Implication des gènes codant pour curli dans l'auto-agglutination et la formation de biofilm dans la souche d'E. coli enterohémorragique Sakai 4e édition du congrès de Bactériologie intégrative: Symbiose et Pathogenèse (BiSP), 2019.

Identification of genes involved in autoagglutination and biofilm formation in Escherichia coli strains O157: H7 69th annual conference of the Canadian society of microbiologist, 2019.

Identification of genes involved in autoagglutination and biofilm formation in E. coli strains O157: H7 ASM Microbes 2019, 2019.

Genomics to feed the future Seminar at the Department of Animal Sciences at Laval University, 2019.

Exploration of the hidden side of the bacterium Leptospira 69th annual conference of the Canadian society of microbiologist abstract, 2019.

Draft genome sequences of four aeromonas salmonicida subsp. Achromogenes strains, 23051, 23053, 23055, and 23056, isolated from senegalese sole (Solea senegalensis) Microbiology Resource Announcements, 2019. Vincent, A.T., Le Breton, A., Bernatchez, A., Gagné-Thivierge, C., Paquet, V.E., Thibault, E., Charette, S.J., Gantelet, H.. DOI 10.1128/MRA.00631-19

Beyond the A-layer: adsorption of lipopolysaccharides and characterization of bacteriophage-insensitive mutants of Aeromonas salmonicida subsp. salmonicida Molecular Microbiology, 2019. Paquet, V.E., Vincent, A.T., Moineau, S., Charette, S.J.. DOI 10.1111/mmi.14308

Au-delà de la A-layer: adsorption aux lipopolysaccharides et caractérisation de mutants résistants aux bactériophages spécifiques d'Aeromonas salmonicida ssp. salmonicida. 4e édition du congrès de Bactériologie intégrative: Symbiose et Pathogenèse (BiSP), 2019.

A mesophilic aeromonas salmonicida strain isolated from an unsuspected host, the migratory bird pied avocet Microorganisms, 2019. Vincent, A.T., Bernatchez, A., Frey, J., Charette, S.J.. DOI 10.3390/microorganisms7120592

A brief history of bioinformatics Briefings in Bioinformatics, 2019. Gauthier, J., Vincent, A.T., Charette, S.J., Derome, N.. DOI 10.1093/bib/bby063