Répertoire du corps professoral

PandemicStop-AI: for an accelerated response to pandemics
Programme: Fonds de recherche biomédical du Canada (FRBC)
Organisme(s) subventionnaire(s): Secrétariat des programmes interorganismes à l’intention des établissements
Type de financement: Subvention
Établissement tête: Université de Montréal
Du 1 mars 2024 au31 mars 2028

Uncovering the nanoscale underpinnings of cognitive decline
Programme: Futurs leaders canadiens de la recherche sur le cerveau
Organisme(s) subventionnaire(s): Instituts de recherche en santé du Canada
Type de financement: Subvention
Établissement tête: Université Laval
Du 1 septembre 2023 au31 août 2025

Repousser les frontières de l'étude de la biologie à l'échelle nanométrique en conditions naturelles
Programme: Fonds d'innovation (FI)
Organisme(s) subventionnaire(s): Fondation Canadienne pour l'innovation (La), CIUSSS-CN CERVO, Ministère de la Santé et des Services sociaux
Type de financement: Subvention
Établissement tête: Université Laval
Du 1 juillet 2023 au31 mars 2025

Découverte d'antimicrobiens ciblant la biogenèse et la perméabilité de la membrane externe par microscopie à haut débit basée sur l'intelligence artificielle
Programme: Programme bilatéral de recherche collaborative Québec - Communauté française de Belgique
Organisme(s) subventionnaire(s): Fonds de recherche du Québec - Santé
Type de financement: Subvention
Établissement tête: Université de Montréal
Du 1 septembre 2022 au31 août 2025

Union Neurosciences et Intelligence Artificielle - Québec (UNIQUE)
Programme: Regroupements stratégiques NT
Organisme(s) subventionnaire(s): Université Laval - Fonds internes, Fonds de recherche du Québec - Nature et technologies
Type de financement: Subvention
Établissement tête: Université de Montréal
Du 1 avril 2022 au31 mars 2028

Optical Nanoscopy of cytoskeletal and synaptic remodeling in neurons
Programme: Subvention Projet
Organisme(s) subventionnaire(s): Instituts de recherche en santé du Canada
Type de financement: Subvention
Établissement tête: Université Laval
Du 31 mars 2021 au31 mars 2027

The exposome-microbiota-brain axis under the microscope to tackle Environment-Health Interactions in the North
Programme: Sentinelle Nord - Deuxième appel à projets majeurs
Organisme(s) subventionnaire(s): Secrétariat des programmes interorganismes à l’intention des établissements
Type de financement: Subvention
Établissement tête: Université Laval
Du 1 novembre 2020 au31 décembre 2024

Extreme zooming on intestinal permeability and the western-style diet: Unravelling the role of dietary antigens on the prevalence of cardiometabolic and mental health diseases in the North
Programme: Sentinelle Nord - Deuxième appel à projets majeurs
Organisme(s) subventionnaire(s): Secrétariat des programmes interorganismes à l’intention des établissements
Type de financement: Subvention
Établissement tête: Université Laval
Du 1 novembre 2020 au31 décembre 2024

Enabling Identification and Impact of Synaptic Weight in Functional Networks
Programme: Subvention d'équipe : Réseaux Next Generation Networks for Neuroscience
Organisme(s) subventionnaire(s): Fonds de recherche du Québec - Santé
Type de financement: Subvention
Établissement tête: Université Laval
Du 1 juillet 2020 au30 juin 2025

Canada research chair in Intelligent Nanoscopy of Cellular Plasticity
Programme: Chaires de recherche du Canada - Fonctionnement
Organisme(s) subventionnaire(s): Conseil de recherches en sciences naturelles et génie Canada
Type de financement: Subvention
Établissement tête: Université Laval
Du 1 novembre 2019 au31 octobre 2024

Pushing the boundaries of super-resolution optical microscopy for molecular imaging in live tissue
Programme: Subventions à la découverte SD (individuelles et d'équipe)
Organisme(s) subventionnaire(s): Conseil de recherches en sciences naturelles et génie Canada
Type de financement: Subvention
Établissement tête: Université Laval
Du 1 avril 2019 au31 mars 2025

Financements des 2 dernières années

Antimicrobial discovery by artificial intelligence-driven high-throughput microscopy
Programme: Programme d’intégration de la génomique
Organisme(s) subventionnaire(s): Génome Québec
Type de financement: Subvention
Établissement tête: Université de Montréal
Du 12 mai 2021 au30 juin 2024

Flashes of light: discovering rare brain events by combining astronomy and microscopy image analysis
Programme: Nouvelles frontières en recherche
Organisme(s) subventionnaire(s): Secrétariat des programmes interorganismes à l’intention des établissements
Type de financement: Subvention
Établissement tête: Université Laval
Du 31 mars 2021 au30 mars 2024

Can Astronomy and Machine Learning help detect neurodegeneraion?
Organisme(s) subventionnaire(s): Institut canadien de recherches avancées
Type de financement: Subvention
Établissement tête: University of Toronto
Du 15 mars 2021 au15 mars 2023

Méthodes d'apprentissage automatique pour le développement de la microscopie intelligente des dynamiques cellulaires
Programme: Projet de recherche en équipe
Organisme(s) subventionnaire(s): Fonds de recherche du Québec - Nature et technologies
Type de financement: Subvention
Établissement tête: Université Laval
Du 1 avril 2020 au31 mars 2023

Programme de soutien aux nouveaux chercheurs
Programme: Soutien facultaire aux jeunes chercheurs de la Faculté de médecine
Organisme(s) subventionnaire(s): Université Laval - Fonds internes
Type de financement: Subvention
Établissement tête: Université Laval
Du 1 novembre 2019 au31 octobre 2022

Pushing the boundaries of super-resolution optical microscopy for molecular imaging in live tissue
Programme: Supplément Tremplin vers la découverte
Organisme(s) subventionnaire(s): Conseil de recherches en sciences naturelles et génie Canada
Type de financement: Subvention
Établissement tête: Université Laval
Du 1 avril 2019 au31 mars 2024

Owen Ferguson, Maîtrise en biophotonique - avec mémoire

Owen Ferguson, Doctorat en biophotonique

Alexy Pelletier-Rioux, Maîtrise en biophotonique - avec mémoire

Koraly Lessard, Maîtrise en informatique - avec mémoire

Laurence-Taïsha Fontaine, Maîtrise en informatique - avec mémoire

William Leclerc, Maîtrise en informatique - avec mémoire

Benoît Turcotte, Maîtrise en génie électrique - avec mémoire

Hadi Moazen, Doctorat en informatique

Catherine Bouchard, Doctorat en génie électrique

Laurence Descombes, Maîtrise en biophotonique - avec mémoire

Antoine Séverin Ollier, Maîtrise en génie électrique - avec mémoire

Albert Michaud-Gagnon, Maîtrise en génie électrique - avec mémoire

Anthony Bilodeau, Doctorat en biophotonique

Antoine Girard, Doctorat en biophotonique

Frédéric Beaupré, Doctorat en biophotonique

Alexis Lebrun, Doctorat en biophotonique

Andréanne Deschênes, Doctorat en biophotonique

Antoine Girard, Maîtrise en neurosciences - avec mémoire

Kamylle Thériault, Maîtrise en médecine moléculaire - avec mémoire

Encadrements terminés dans les 5 dernières années

Renaud Bernatchez, Maîtrise en biophotonique - avec mémoire

Catherine Bouchard, Maîtrise en génie électrique - avec mémoire

Anthony Bilodeau, Maîtrise en biophotonique - avec mémoire

Vincent Boily, Maîtrise en biophotonique - avec mémoire

Louis-Emile Robitaille, Maîtrise en génie électrique - avec mémoire

Theresa Wiesner, Doctorat en biophotonique

Pierre-Luc Ayotte-Nadeau, Maîtrise en biophotonique - avec mémoire

Jean-Michel Bellavance, Maîtrise en neurosciences - avec mémoire

Publications des 5 dernières années

Development of AI-assisted microscopy frameworks through realistic simulation in pySTED 2024/03/29. Anthony Bilodeau, Albert Michaud-Gagnon, Julia Chabbert, Benoit Turcotte, Jörn Heine, Audrey Durand, Flavie Lavoie-Cardinal. DOI 10.1101/2024.03.25.586697

Resolution enhancement with a task-assisted GAN to guide optical nanoscopy image analysis and acquisition Nature Machine Intelligence, 2023/07/27. Catherine Bouchard, Theresa Wiesner, Andréanne Deschênes, Anthony Bilodeau, Benoît Turcotte, Christian Gagné, Flavie Lavoie-Cardinal. DOI 10.1038/s42256-023-00689-3

Microscopy analysis neural network to solve detection, enumeration and segmentation from image-level annotations Nature Machine Intelligence, 2022/04/14. Anthony Bilodeau, Constantin V. L. Delmas, Martin Parent, Paul De Koninck, Audrey Durand, Flavie Lavoie-Cardinal. DOI 10.1038/s42256-022-00472-w

MICRA-Net: MICRoscopy Analysis Neural Network to solve detection, classification, and segmentation from a single simple auxiliary task 2021/06/30. Anthony Bilodeau, Constantin V.L. Delmas, Martin Parent, Paul De Koninck, Audrey Durand, Flavie Lavoie-Cardinal. DOI 10.1101/2021.06.29.448970

Neuronal activity remodels the F-actin based submembrane lattice in dendrites but not axons of hippocampal neurons 2020/05/30. Flavie Lavoie-Cardinal, Anthony Bilodeau, Mado Lemieux, Marc-André Gardner, Theresa Wiesner, Gabrielle Laramée, Christian Gagné, Paul De Koninck. DOI 10.1101/2020.05.27.119453

Nano-positioning and tubuline conformation determine transport of mitochondria along microtubules 2020/04/28. V. Van Steenbergen, F. Lavoie-Cardinal, Y. Kazwiny, M. Decet, T. Martens, P. Verstreken, W. Boesmans, P. De Koninck, P. Vanden Berghe. DOI 10.1101/2020.04.27.064766