Répertoire du corps professoral

Intelligent Nanoscopy of Cellular Plasticity
Programme: Chaires de recherche du Canada - Fonctionnement
Organisme(s) subventionnaire(s): Instituts de recherche en santé du Canada
Type de financement: Subvention
Établissement tête: Université Laval
Du 1 novembre 2024 au 31 octobre 2029

PandemicStop-AI: for an accelerated response to pandemics
Programme: Fonds de recherche biomédical du Canada (FRBC)
Organisme(s) subventionnaire(s): Secrétariat des programmes interorganismes à l’intention des établissements
Type de financement: Subvention
Établissement tête: Université de Montréal
Du 1 mars 2024 au 31 mars 2028

Uncovering the nanoscale underpinnings of cognitive decline
Programme: Futurs leaders canadiens de la recherche sur le cerveau
Organisme(s) subventionnaire(s): Instituts de recherche en santé du Canada
Type de financement: Subvention
Établissement tête: Université Laval
Du 1 septembre 2023 au 31 août 2025

Repousser les frontières de l'étude de la biologie à l'échelle nanométrique en conditions naturelles
Programme: Fonds d'innovation (FI)
Organisme(s) subventionnaire(s): Fondation Canadienne pour l'innovation (La), CIUSSS-CN CERVO, Ministère de l'Économie et de l'Innovation et de l'énergie, Ministère de la Santé et des Services sociaux
Type de financement: Subvention
Établissement tête: Université Laval
Du 1 juillet 2023 au 31 mars 2025

Découverte d'antimicrobiens ciblant la biogenèse et la perméabilité de la membrane externe par microscopie à haut débit basée sur l'intelligence artificielle
Programme: Programme bilatéral de recherche collaborative Québec - Communauté française de Belgique
Organisme(s) subventionnaire(s): Fonds de recherche du Québec - Santé
Type de financement: Subvention
Établissement tête: Université de Montréal
Du 1 septembre 2022 au 31 août 2025

Union Neurosciences et Intelligence Artificielle - Québec (UNIQUE)
Programme: Regroupements stratégiques NT
Organisme(s) subventionnaire(s): Université Laval - Fonds internes, Fonds de recherche du Québec - Nature et technologies
Type de financement: Subvention
Établissement tête: Université de Montréal
Du 1 avril 2022 au 31 mars 2028

Optical Nanoscopy of cytoskeletal and synaptic remodeling in neurons
Programme: Subvention Projet
Organisme(s) subventionnaire(s): Instituts de recherche en santé du Canada
Type de financement: Subvention
Établissement tête: Université Laval
Du 31 mars 2021 au 31 mars 2027

Extreme zooming on intestinal permeability and the western-style diet: Unravelling the role of dietary antigens on the prevalence of cardiometabolic and mental health diseases in the North
Programme: Sentinelle Nord - Deuxième appel à projets majeurs
Organisme(s) subventionnaire(s): Secrétariat des programmes interorganismes à l’intention des établissements
Type de financement: Subvention
Établissement tête: Université Laval
Du 1 novembre 2020 au 31 décembre 2024

The exposome-microbiota-brain axis under the microscope to tackle Environment-Health Interactions in the North
Programme: Sentinelle Nord - Deuxième appel à projets majeurs
Organisme(s) subventionnaire(s): Secrétariat des programmes interorganismes à l’intention des établissements
Type de financement: Subvention
Établissement tête: Université Laval
Du 1 novembre 2020 au 31 décembre 2024

Enabling Identification and Impact of Synaptic Weight in Functional Networks
Programme: Subvention d'équipe : Réseaux Next Generation Networks for Neuroscience
Organisme(s) subventionnaire(s): Fonds de recherche du Québec - Santé
Type de financement: Subvention
Établissement tête: Université Laval
Du 1 juillet 2020 au 30 juin 2025

Pushing the boundaries of super-resolution optical microscopy for molecular imaging in live tissue
Programme: Subventions à la découverte SD (individuelles et d'équipe)
Organisme(s) subventionnaire(s): Conseil de recherches en sciences naturelles et génie Canada
Type de financement: Subvention
Établissement tête: Université Laval
Du 1 avril 2019 au 31 mars 2026

Financements des 2 dernières années

Antimicrobial discovery by artificial intelligence-driven high-throughput microscopy
Programme: Programme d’intégration de la génomique
Organisme(s) subventionnaire(s): Génome Québec
Type de financement: Subvention
Établissement tête: Université de Montréal
Du 12 mai 2021 au 30 juin 2024

Flashes of light: discovering rare brain events by combining astronomy and microscopy image analysis
Programme: Nouvelles frontières en recherche
Organisme(s) subventionnaire(s): Secrétariat des programmes interorganismes à l’intention des établissements
Type de financement: Subvention
Établissement tête: Université Laval
Du 31 mars 2021 au 30 mars 2024

Can Astronomy and Machine Learning help detect neurodegeneraion?
Organisme(s) subventionnaire(s): Institut canadien de recherches avancées
Type de financement: Subvention
Établissement tête: University of Toronto
Du 15 mars 2021 au 15 mars 2023

Méthodes d'apprentissage automatique pour le développement de la microscopie intelligente des dynamiques cellulaires
Programme: Projet de recherche en équipe
Organisme(s) subventionnaire(s): Fonds de recherche du Québec - Nature et technologies
Type de financement: Subvention
Établissement tête: Université Laval
Du 1 avril 2020 au 31 mars 2023

Canada research chair in Intelligent Nanoscopy of Cellular Plasticity
Programme: Chaires de recherche du Canada - Fonctionnement
Organisme(s) subventionnaire(s): Conseil de recherches en sciences naturelles et génie Canada
Type de financement: Subvention
Établissement tête: Université Laval
Du 1 novembre 2019 au 31 octobre 2024

Pushing the boundaries of super-resolution optical microscopy for molecular imaging in live tissue
Programme: Supplément Tremplin vers la découverte
Organisme(s) subventionnaire(s): Conseil de recherches en sciences naturelles et génie Canada
Type de financement: Subvention
Établissement tête: Université Laval
Du 1 avril 2019 au 31 mars 2024

Koraly Lessard, Maîtrise en informatique - avec mémoire

Owen Ferguson, Doctorat en biophotonique

Alexy Pelletier-Rioux, Maîtrise en biophotonique - avec mémoire

Frédéric Beaupré, Maîtrise en biophotonique - avec mémoire

Frédéric Beaupré, Doctorat en biophotonique

Laurence-Taïsha Fontaine, Maîtrise en informatique - avec mémoire

Anthony Bilodeau, Doctorat en biophotonique

Antoine Girard, Doctorat en biophotonique

Hadi Moazen, Doctorat en informatique

Catherine Bouchard, Doctorat en génie électrique

Laurence Descombes, Maîtrise en biophotonique - avec mémoire

William Leclerc, Maîtrise en informatique - avec mémoire

Alexis Lebrun, Doctorat en biophotonique

Andréanne Deschênes, Doctorat en biophotonique

Kamylle Thériault, Maîtrise en médecine moléculaire - avec mémoire

Encadrements terminés dans les 5 dernières années

Owen Ferguson, Maîtrise en biophotonique - avec mémoire

Renaud Bernatchez, Maîtrise en biophotonique - avec mémoire

Pierre-Luc Ayotte-Nadeau, Maîtrise en biophotonique - avec mémoire

Anthony Bilodeau, Maîtrise en biophotonique - avec mémoire

Benoît Turcotte, Maîtrise en génie électrique - avec mémoire

Catherine Bouchard, Maîtrise en génie électrique - avec mémoire

Antoine Séverin Ollier, Maîtrise en génie électrique - avec mémoire

Albert Michaud-Gagnon, Maîtrise en génie électrique - avec mémoire

Vincent Boily, Maîtrise en biophotonique - avec mémoire

Louis-Emile Robitaille, Maîtrise en génie électrique - avec mémoire

Theresa Wiesner, Doctorat en biophotonique

Jean-Michel Bellavance, Maîtrise en neurosciences - avec mémoire

Antoine Girard, Maîtrise en neurosciences - avec mémoire

Publications des 5 dernières années

Development of AI-assisted microscopy frameworks through realistic simulation with pySTED Nature Machine Intelligence, 2024/09/26. Anthony Bilodeau, Albert Michaud-Gagnon, Julia Chabbert, Benoit Turcotte, Jörn Heine, Audrey Durand, Flavie Lavoie-Cardinal. DOI 10.1038/s42256-024-00903-w

Development of AI-assisted microscopy frameworks through realistic simulation in pySTED 2024/03/29. Anthony Bilodeau, Albert Michaud-Gagnon, Julia Chabbert, Benoit Turcotte, Jörn Heine, Audrey Durand, Flavie Lavoie-Cardinal. DOI 10.1101/2024.03.25.586697

Resolution enhancement with a task-assisted GAN to guide optical nanoscopy image analysis and acquisition Nature Machine Intelligence, 2023/07/27. Catherine Bouchard, Theresa Wiesner, Andréanne Deschênes, Anthony Bilodeau, Benoît Turcotte, Christian Gagné, Flavie Lavoie-Cardinal. DOI 10.1038/s42256-023-00689-3

Microscopy analysis neural network to solve detection, enumeration and segmentation from image-level annotations Nature Machine Intelligence, 2022/04/14. Anthony Bilodeau, Constantin V. L. Delmas, Martin Parent, Paul De Koninck, Audrey Durand, Flavie Lavoie-Cardinal. DOI 10.1038/s42256-022-00472-w

MICRA-Net: MICRoscopy Analysis Neural Network to solve detection, classification, and segmentation from a single simple auxiliary task 2021/06/30. Anthony Bilodeau, Constantin V.L. Delmas, Martin Parent, Paul De Koninck, Audrey Durand, Flavie Lavoie-Cardinal. DOI 10.1101/2021.06.29.448970

Neuronal activity remodels the F-actin based submembrane lattice in dendrites but not axons of hippocampal neurons 2020/05/30. Flavie Lavoie-Cardinal, Anthony Bilodeau, Mado Lemieux, Marc-André Gardner, Theresa Wiesner, Gabrielle Laramée, Christian Gagné, Paul De Koninck. DOI 10.1101/2020.05.27.119453

Nano-positioning and tubuline conformation determine transport of mitochondria along microtubules 2020/04/28. V. Van Steenbergen, F. Lavoie-Cardinal, Y. Kazwiny, M. Decet, T. Martens, P. Verstreken, W. Boesmans, P. De Koninck, P. Vanden Berghe. DOI 10.1101/2020.04.27.064766