Répertoire du corps professoral

Gut microbiota biomarkers to personalize treatment of bladder cancer
Programme: Proof-of-Principle 2024: Microbial biomarkers of disease and therapeutic response
Organisme(s) subventionnaire(s): Weston Family Foundation
Type de financement: Subvention
Établissement tête: Université Laval
Du 1 décembre 2024 au 30 avril 2027

À quoi devrait servir le microbiote intestinal pour les nutritionnistes ?
Programme: Nouveaux Centres et Instituts de recherche - Subventions régulières
Organisme(s) subventionnaire(s): Fonds de recherche du Québec - Santé
Type de financement: Subvention
Établissement tête: Université Laval
Du 2 juillet 2024 au 31 juillet 2025

Institut sur la nutrition et les aliments fonctionnels (INAF)
Programme: Regroupements stratégiques NT
Organisme(s) subventionnaire(s): Université Concordia, Institut national de recherche scientifique (INRS), Université du Québec à Rimouski, Fonds de recherche du Québec - Nature et technologies, Université McGill, Université Laval - Fonds internes, Merinov - Centre d'innovation de l'aquaculture et des pêches du Québec
Type de financement: Subvention
Établissement tête: Université Laval
Du 1 avril 2024 au 31 mars 2030

Impact of the gut microbiome on the cardioprotective potential of diet in heterozygous familial hypercholesterolemia
Programme: 2018 Proof-of-Principle Grant Call
Organisme(s) subventionnaire(s): Weston Family Foundation
Type de financement: Subvention
Établissement tête: Université Laval
Du 1 janvier 2024 au 31 décembre 2026

Machine learning modeling of diet, microbiome and host interactions to formulate nutritional interventions
Programme: Proof-of-Principle 2023: The Microbiome and Precision Nutrition
Organisme(s) subventionnaire(s): Weston Family Foundation
Type de financement: Subvention
Établissement tête: Université Laval
Du 1 janvier 2024 au 31 août 2026

Étude des mécanismes du microbiote intestinal et de son métabolisme à l'aide d'un système de simulation intestinal in vitro
Programme: Fonds des leaders John-R.-Evans (FLJR)
Organisme(s) subventionnaire(s): Ministère de l'Économie et de l'Innovation, Institut sur la nutrition et les aliments fonctionnels, Fondation Canadienne pour l'innovation (La)
Type de financement: Subvention
Établissement tête: Université Laval
Du 1 juillet 2023 au 31 décembre 2024

L'empreinte métabolomique plasmatique des produits laitiers: un reflet de leur consommation et une fenêtre sur leurs effets cardiométaboliques
Programme: Subvention à la recherche en nutrition
Organisme(s) subventionnaire(s): MITACS Inc., Les producteurs laitiers du Canada
Type de financement: Subvention
Établissement tête: Université Laval
Du 1 janvier 2023 au 1 octobre 2025

Systems modelling of microbial communities using in vitro and computational approaches
Programme: Subventions à la découverte SD (individuelles et d'équipe)
Organisme(s) subventionnaire(s): Conseil de recherches en sciences naturelles et génie Canada
Type de financement: Subvention
Établissement tête: Université Laval
Du 1 avril 2020 au 31 mars 2026

Systems modelling of microbial communities using in vitro and computational approaches
Programme: Supplément Tremplin vers la découverte
Organisme(s) subventionnaire(s): Conseil de recherches en sciences naturelles et génie Canada
Type de financement: Subvention
Établissement tête: Université Laval
Du 1 avril 2020 au 31 mars 2025

MuscULo, une chaire de recherche sur la qualité et la salubrité de la viande.
Programme: Chaire de recherche en partenariat
Organisme(s) subventionnaire(s): Ministère de l'agriculture, des pêcheries et de l'alimentation, Olymel, Kersia
Type de financement: Subvention
Établissement tête: Université Laval
Du 16 octobre 2019 au 31 août 2025

Financements des 2 dernières années

Développement d’un pipeline d’analyse de données de méthylation issues d’appareil de séquençage Oxford Nanopore Technology
Programme: Nouveaux Centres et Instituts de recherche - Subventions régulières
Organisme(s) subventionnaire(s): Fonds de recherche du Québec - Santé
Type de financement: Subvention
Établissement tête: Université Laval
Du 20 avril 2023 au 31 mars 2024

Système de chromatographie en phase gazeuse couplé à un spectromètre de masse pour le développement d’une plateforme de volatilomique dédiée au domaine bioalimentaire
Programme: Subventions d'outils et d'instruments de recherche (OIR)
Organisme(s) subventionnaire(s): Conseil de recherches en sciences naturelles et génie Canada
Type de financement: Subvention
Établissement tête: Université Laval
Du 31 mars 2023 au 31 mars 2024

Microbiome-endocannabinoidome role in response to prebiotic and probiotic interventions in a Murine Model of Diet-Induced Metabolic Syndrome
Programme: Accélération-Élévation
Organisme(s) subventionnaire(s): MITACS Inc.
Type de financement: Subvention
Établissement tête: Université Laval
Du 1 janvier 2023 au 15 décembre 2023

Gut microbiota-derived metabolite response to diet in type 2 diabetes
Programme: Subventions pour la recherche
Organisme(s) subventionnaire(s): Diabète Québec
Type de financement: Subvention
Établissement tête: Université Laval
Du 1 juillet 2022 au 30 juin 2023

Étude préliminaire pour la prédiction des bactéries hôtes des phages dans des échantillons de microbiote grâce aux motifs de méthylation de l'ADN
Programme: Projet subsidiaire d'un regroupement stratégique
Organisme(s) subventionnaire(s): Fonds de recherche du Québec - Nature et technologies
Type de financement: Subvention
Établissement tête: Université Laval
Du 1 février 2022 au 31 janvier 2023

Une infrastructure IA multi-usagers clé en main pour gérer le cycle de vie complet des données en santé
Programme: BDR - Cas spéciaux et obligations institutionnelles
Organisme(s) subventionnaire(s): Université Laval - Fonds internes
Type de financement: Subvention
Établissement tête: Université Laval
Du 1 avril 2021 au 30 juin 2024

Impact of lifestyle on gut barrier function, bacterial translocation and risk of prostate cancer
Organisme(s) subventionnaire(s): Weston Family Foundation
Type de financement: Subvention
Établissement tête: Université Laval
Du 1 septembre 2020 au 30 avril 2023

En route towards prebiotic clinical trials for enhancement of immunotherapies in bladder and prostate cancers
Programme: Transformational Research
Organisme(s) subventionnaire(s): Weston Family Foundation
Type de financement: Subvention
Établissement tête: Université Laval
Du 1 juin 2020 au 30 avril 2024

Toward a decrease in dietary crude protein in broilers: amino acids adjustment considering both structural and functional roles, fine tuning of mineral profile, and energy:protein
Programme: Subventions de recherche et développement coopérative (RDC)
Organisme(s) subventionnaire(s): Secrétariat Inter-Conseils (Canada) (CRSH, CRSNG, IRSC), Conseil de recherches en sciences naturelles et génie Canada, Ajinomoto Animal Nutrition Europe
Type de financement: Subvention
Établissement tête: Université Laval
Du 1 mars 2020 au 31 octobre 2023

Dissecting host-microbiome modifiers of type 2 diabetes risk - Objective 1.1
Programme: Subvention d'équipe : Initiative canadienne microbiome 2 : Équipes de recherche
Organisme(s) subventionnaire(s): Instituts de recherche en santé du Canada
Type de financement: Subvention
Établissement tête: Université Laval
Du 1 novembre 2019 au 31 octobre 2024

Dissecting host-microbiome modifiers of type 2 diabetes risk - Objective 1.3
Programme: Subvention d'équipe : Initiative canadienne microbiome 2 : Équipes de recherche
Organisme(s) subventionnaire(s): Instituts de recherche en santé du Canada
Type de financement: Subvention
Établissement tête: Université Laval
Du 1 novembre 2019 au 31 octobre 2024

Dissecting host-microbiome modifiers of type 2 diabetes risk - Objective 1.2
Programme: Subvention d'équipe : Initiative canadienne microbiome 2 : Équipes de recherche
Organisme(s) subventionnaire(s): Instituts de recherche en santé du Canada
Type de financement: Subvention
Établissement tête: Université Laval
Du 1 novembre 2019 au 31 octobre 2024

Dissecting host-microbiome modifiers of type 2 diabetes risk
Programme: Subvention d'équipe : Initiative canadienne microbiome 2 : Équipes de recherche
Organisme(s) subventionnaire(s): Instituts de recherche en santé du Canada
Type de financement: Subvention
Établissement tête: Université Laval
Du 1 novembre 2019 au 31 octobre 2024

Institut sur la nutrition et les aliments fonctionnels (INAF)
Programme: Regroupements stratégiques NT
Organisme(s) subventionnaire(s): Institut national de recherche scientifique (INRS), Fonds de recherche du Québec - Nature et technologies, Université Laval - Fonds internes, Université McGill, Université du Québec à Rimouski, Université de Sherbrooke
Type de financement: Subvention
Établissement tête: Université Laval
Du 1 avril 2017 au 31 mars 2024

Encadrements terminés dans les 5 dernières années

Alexandrine Pimont, Maîtrise en sciences animales - avec mémoire

Fredy Alexander Guevara Agudelo, Doctorat en nutrition

Fabiola Forteza, Maîtrise en nutrition - avec mémoire

Roxanne Plante, Maîtrise en médecine moléculaire - avec mémoire

Publications des 5 dernières années

The Human Fecal Endocannabinoidome Mediator Profile Is Mainly Defined by the Fecal Microbiota and Diet The Journal of Clinical Endocrinology & Metabolism, 2024/08/22. Sophie Castonguay-Paradis, Lydiane Parent, Gabrielle St-Arnaud, Julie Perron, Élizabeth Dumais, Nicolas Flamand, Frédéric Raymond, Vincenzo Di Marzo, Alain Veilleux. DOI 10.1210/clinem/dgae586

Preslaughter feed withdrawal time and its effect on rabbit blood measures, gastrointestinal tract parameters and Longissimus lumborum glycolytic potential World Rabbit Science, 2023/12/26. Anne-Sophie Larivière-Lajoie, Pascal Laforge, Antony Tony Vincent, Simon Binggeli, Dany Cinq-Mars, Frédéric Guay, Frédéric Raymond, Antoni Dalmau, Linda Saucier. DOI 10.4995/wrs.2023.19177

Gene-based microbiome representation enhances host phenotype classification mSystems, 2023/07/05. Thomas Deschênes, Fred Wilfried Elom Tohoundjona, Pier-Luc Plante, Vincenzo Di Marzo, Frédéric Raymond. DOI 10.1128/msystems.00531-23

The diet rapidly and differentially affects the gut microbiota and host lipid mediators in a healthy population Microbiome, 2023. Bourdeau-Julien, I., Castonguay-Paradis, S., Rochefort, G., Perron, J., Lamarche, B., Flamand, N., Di Marzo, V., Veilleux, A., Raymond, F.. DOI 10.1186/s40168-023-01469-2

Comparing Transgenic Production to Supplementation of ω-3 PUFA Reveals Distinct but Overlapping Mechanisms Underlying Protection Against Metabolic and Hepatic Disorders Function, 2023. Daniel, N., Le Barz, M., Mitchell, P.L., Varin, T.V., Julien, I.B., Farabos, D., Pilon, G., Gauthier, J., Garofalo, C., Kang, J.X., Trottier, J., Barbier, O., Roy, D., Chassaing, B., Levy, E., Raymond, F., Lamaziere, A., Flamand, N., Silvestri, C., Jobin, C., Di Marzo, V., Marette, A.. DOI 10.1093/function/zqac069

Characterization of vancomycin-resistance vanD gene clusters in the human intestinal microbiota by metagenomics and culture-enriched metagenomics JAC-Antimicrobial Resistance, 2023. Brochu, E., Huletsky, A., Boudreau, D.K., Raymond, F., Berube, È., Ouameur, A.A., Frenette, J., Boissinot, M., Corbeil, J., Bergeron, M.G.. DOI 10.1093/jacamr/dlad026

Influence of diet on acute endocannabinoidome mediator levels post exercise in active women, a crossover randomized study Scientific Reports, 2022. Forteza, F., Bourdeau-Julien, I., Nguyen, G.Q., Guevara Agudelo, F.A., Rochefort, G., Parent, L., Rakotoarivelo, V., Feutry, P., Martin, C., Perron, J., Lamarche, B., Flamand, N., Veilleux, A., Billaut, F., Di Marzo, V., Raymond, F.. DOI 10.1038/s41598-022-10757-0

Impact of selenium on the intestinal microbiome-eCBome axis in the context of diet-related metabolic health in mice Frontiers in Immunology, 2022. Guevara Agudelo, F.A., Leblanc, N., Bourdeau-Julien, I., St-Arnaud, G., Lacroix, S., Martin, C., Flamand, N., Veilleux, A., Di Marzo, V., Raymond, F.. DOI 10.3389/fimmu.2022.1028412

Analysis of the oral microbiome during hormonal cycle and its alterations in menopausal women: the “AMICA” project Scientific Reports, 2022. Tramice, A., Paris, D., Manca, A., Guevara Agudelo, F.A., Petrosino, S., Siracusa, L., Carbone, M., Melck, D., Raymond, F., Piscitelli, F.. DOI 10.1038/s41598-022-26528-w

Neurobiological Processes Induced by Aerobic Exercise through the Endocannabinoidome Cells, 2021/04/17. Fabiola Forteza, Giada Giorgini, Frédéric Raymond. DOI 10.3390/cells10040938

Criibacterium bergeronii gen. nov., sp. nov., a new member of the family Peptostreptococcaceae, isolated from human clinical samples International Journal of Systematic and Evolutionary Microbiology, 2021/03/01. Andrée F. Maheux, Dominique K. Boudreau, Jehane Y. Abed, Ève Bérubé, Stéphanie Brodeur, Kathryn A. Bernard, Ameena Hashimi, Éloïse Ducrey, Émilie F. Guay, Frédéric Raymond, Jacques Corbeil, Marc-Christian Domingo, Paul H. Roy, Maurice Boissinot, Elitza I. Tocheva, Rabeea F. Omar. DOI 10.1099/ijsem.0.004691

Genomic diversity and CRISPR-Cas systems in the cyanobacterium Nostoc in the High Arctic Environmental Microbiology, 2021. Jungblut, A.D., Raymond, F., Dion, M.B., Moineau, S., Mohit, V., Nguyen, G.Q., Déraspe, M., Francovic-Fontaine, É., Lovejoy, C., Culley, A.I., Corbeil, J., Vincent, W.F.. DOI 10.1111/1462-2920.15481

Dietary fatty acid intake and gut microbiota determine circulating endocannabinoidome signaling beyond the effect of body fat Scientific Reports, 2020. Castonguay-Paradis, S., Lacroix, S., Rochefort, G., Parent, L., Perron, J., Martin, C., Lamarche, B., Raymond, F., Flamand, N., Di Marzo, V., Veilleux, A.. DOI 10.1038/s41598-020-72861-3

Blueberry proanthocyanidins and anthocyanins improve metabolic health through a gut microbiota-dependent mechanism in diet-induced obese mice American Journal of Physiology - Endocrinology and Metabolism, 2020. Morissette, A., Kropp, C., Songpadith, J.-P., Moreira, R.J., Costa, J., Mariné-Casadó, R., Pilon, G., Varin, T.V., Dudonné, S., Boutekrabt, L., St-Pierre, P., Levy, E., Roy, D., Desjardins, Y., Raymond, F., Houd, V.P., Marette, A.. DOI 10.1152/AJPENDO.00560.2019

Culture-enriched human gut microbiomes reveal core and accessory resistance genes Microbiome, 2019/12. Frédéric Raymond, Maurice Boissinot, Amin Ahmed Ouameur, Maxime Déraspe, Pier-Luc Plante, Sewagnouin Rogia Kpanou, Ève Bérubé, Ann Huletsky, Paul H. Roy, Marc Ouellette, Michel G. Bergeron, Jacques Corbeil. DOI 10.1186/s40168-019-0669-7

2017 Outbreak of Ebola Virus Disease in Northern Democratic Republic of Congo. The Journal of infectious diseases, 2019/04/03. DOI 10.1093/infdis/jiz107

Interpretable genotype-to-phenotype classifiers with performance guarantees Scientific Reports, 2019/03/11. Alexandre Drouin, Gaël Letarte, Frédéric Raymond, Mario Marchand, Jacques Corbeil, François Laviolette. DOI 10.1038/s41598-019-40561-2

Rapid and concomitant gut microbiota and endocannabinoidome response to diet-induced obesity in mice mSystems, 2019. Lacroix, S., Pechereau, F., Leblanc, N., Boubertakh, B., Houde, A., Martin, C., Flamand, N., Silvestri, C., Raymond, F., Marzo, V.D., Veilleuxa, A.. DOI 10.1128/mSystems.00407-19

Clostridium difficile: Investigating Transmission Patterns between Infected and Colonized Patients Using Whole Genome Sequencing Clinical Infectious Diseases, 2019. Kong, L.Y., Eyre, D.W., Corbeil, J., Raymond, F., Walker, A.S., Wilcox, M.H., Crook, D.W., Michaud, S., Toye, B., Frost, E., Dendukuri, N., Schiller, I., Bourgault, A.-M., Dascal, A., Oughton, M., Longtin, Y., Poirier, L., Brassard, P., Turgeon, N., Gilca, R., Loo, V.G.. DOI 10.1093/cid/ciy457