Répertoire du corps professoral

Cell Signaling in Cancer (9-10 oct. 2024)
Organisme(s) subventionnaire(s): Fondation Gairdner (La)
Type de financement: Subvention
Établissement tête: Université Laval
Du 30 mai 2024 au 31 mars 2025

Regroupement Québécois de Recherche sur la Fonction, l’Ingénierie et les Applications des Protéines
Programme: Regroupements stratégiques NT
Organisme(s) subventionnaire(s): Fonds de recherche du Québec - Nature et technologies
Type de financement: Subvention
Établissement tête: Université du Québec à Montréal - UQAM
Du 1 avril 2024 au 31 mars 2030

Mécanismes moléculaires orchestrant la transition épithélio-mésenchymateuse
Programme: Projet de recherche en équipe
Organisme(s) subventionnaire(s): Fonds de recherche du Québec - Nature et technologies
Type de financement: Subvention
Établissement tête: Université Laval
Du 1 avril 2023 au 31 mars 2026

Functional analysis of the NuA4/TIP60 complex in epigenetic mechanisms linked to genome expression and stability
Programme: Subvention Projet
Organisme(s) subventionnaire(s): Instituts de recherche en santé du Canada
Type de financement: Subvention
Établissement tête: Université Laval
Du 1 octobre 2022 au 30 septembre 2027

Role of MYST-ING acetyltransferase complexes in transcription regulation, cell fate and disease
Programme: Subvention Projet
Organisme(s) subventionnaire(s): Instituts de recherche en santé du Canada
Type de financement: Subvention
Établissement tête: Université Laval
Du 1 juillet 2022 au 30 juin 2027

Defining nucleosome features regulating the function of chromatin modifiers and remodelers
Programme: Subventions à la découverte SD (individuelles et d'équipe)
Organisme(s) subventionnaire(s): Conseil de recherches en sciences naturelles et génie Canada
Type de financement: Subvention
Établissement tête: Université Laval
Du 1 avril 2022 au 31 mars 2027

Plateforme de culture cellulaire pour l'analyse fonctionnelle de modificateurs épigénétiques liés aux maladies humaines
Programme: Fonds des leaders John-R.-Evans (FLJR)
Organisme(s) subventionnaire(s): Fondation Canadienne pour l'innovation (La), Ministère de la Santé et des Services sociaux
Type de financement: Subvention
Établissement tête: Université Laval
Du 1 avril 2022 au 31 mars 2025

Tetrahymena thermophila - un model évolutionnaire divergent pour découvrir de nouveau modes de régulation transcriptionnelle
Programme: Programme NOVA- FRQNT-CRSNG pour chercheurs et chercheuses en début de carrière (PILOTE)
Organisme(s) subventionnaire(s): Conseil de recherches en sciences naturelles et génie Canada, Fonds de recherche du Québec - Nature et technologies
Type de financement: Subvention
Établissement tête: Université Laval
Du 15 mars 2022 au 14 mars 2025

Functional analysis of the NuA4/TIP60 complex in epigenetic mechanisms linked to genome expression and stability
Programme: Subvention Projet
Organisme(s) subventionnaire(s): Instituts de recherche en santé du Canada
Type de financement: Subvention
Établissement tête: Université Laval
Du 1 mars 2022 au 31 mars 2027

Financements des 2 dernières années

Understanding the molecular determinants of high-grade endometrial stromal sarcomas
Programme: Subvention de fonctionnement
Organisme(s) subventionnaire(s): Société de recherche sur le cancer
Type de financement: Subvention
Établissement tête: Université Laval
Du 1 septembre 2022 au 31 août 2024

Erell Cadoret, Doctorat en biologie cellulaire et moléculaire

Encadrements terminés dans les 5 dernières années

Maeva Devoucoux, Doctorat en biologie cellulaire et moléculaire

Jonathan Humbert, Doctorat en biologie cellulaire et moléculaire

Amel Mameri, Maîtrise en biologie cellulaire et moléculaire - avec mémoire

Deepthi Sudarshan, Doctorat en biologie cellulaire et moléculaire

Salar Ahmad, Doctorat en biologie cellulaire et moléculaire

Publications des 5 dernières années

Functional interaction between transcription factor Sfp1 and the NuA4 complex in response to nutrient availability 2024/10/28. Ke Xu, Charles Joly Beauparlant, Stéphanie Bianco, Valérie Côté, Lara Hermann, Arnaud Droit, Michael Downey, Amine Nourani, Jacques Côté. DOI 10.1101/2024.10.28.620578

Structural insights into the human NuA4/TIP60 acetyltransferase and chromatin remodeling complex. Science (New York, N.Y.), 2024/08/23. zhenlin yang, Amel Mameri, Claudia Cattoglio, Catherine Lachance, Alfredo Jose Florez Ariza, Jie Luo, Jonathan Humbert, Deepthi Sudarshan, Arul Banerjea, Maxime Galloy, Amelie Fradet-Turcotte, Jean-Philippe Lambert, Jeffrey Ranish, Jacques Cote, Eva Nogales. DOI 10.1126/science.adl5816

Histone H2A variants play a key role at DNA double-strand breaks during repair pathway choice Frontiers in Epigenetics and Epigenomics, 2024/08/22. Emile Clerf, Maxime Galloy, Amélie Fradet-Turcotte, Jacques Côté. DOI 10.3389/freae.2024.1445765

ASXLs binding to the PHD2/3 fingers of MLL4 provides a mechanism for the recruitment of BAP1 to active enhancers. Nature communications, 2024/06/07. Yi Zhang, Guojia Xie, Ji-Eun Lee, Mohamad Zandian, Sudarshan D, Estavoyer B, Caroline Benz, Viita T, Asgaritarghi G, Lachance C, Messmer C, Leandro Simonetti, Sinha VK, Jean-Philippe Lambert, Chen YW, Shu-Ping Wang, Ylva Ivarsson, El Bachir Affar, Jacques Cote, Kai Ge, Tatiana Kutateladze. DOI 10.1038/s41467-024-49391-x

HBO1, a MYSTerious KAT and its links to cancer. Biochimica et biophysica acta. Gene regulatory mechanisms, 2024/06/06. Yokoyama A, Niida H, Kutateladze TG, Côté J. DOI 10.1016/j.bbagrm.2024.195045

The Functional Relationship Between RNA Splicing and the Chromatin Landscape. Journal of molecular biology, 2024/05/16. Yustis JC, Devoucoux M, Côté J. DOI 10.1016/j.jmb.2024.168614

Guiding the HBO1 complex function through the JADE subunit. Nature structural & molecular biology, 2024/03/06. Gaurav N, Akinori Kanai, Lachance C, Cox KL, Liu J, Adrian Grzybowski, Saksouk N, Klein BJ, Komata Y, Shuhei Asada, Alexander Ruthenburg, Poirier MG, Jacques Cote, Akihiko Yokoyama, Tatiana Kutateladze. DOI 10.1038/s41594-024-01245-2

The immediate-early protein 1 of human herpesvirus 6B interacts with NBS1 and inhibits ATM signaling EMBO Reports, 2024/01/02. Vanessa Collin, Élise Biquand, Vincent Tremblay, Élise G Lavoie, Andréanne Blondeau, Annie Gravel, Maxime Galloy, Anahita Lashgari, Julien Dessapt, Jacques Côté, Louis Flamand, Amélie Fradet-Turcotte. DOI 10.1038/s44319-023-00035-z

JAZF1: A metabolic actor subunit of the NuA4/TIP60 chromatin modifying complex. Frontiers in cell and developmental biology, 2023/04/07. Mameri A, Côté J. DOI 10.3389/fcell.2023.1134268

MORF and MOZ acetyltransferases target unmethylated CpG islands through the winged helix domain. Nature communications, 2023/02/08. Dustin C. Becht, Brianna Klein, Akinori Kanai, Jang SM, Cox KL, Bing-Rui Zhou, Phanor SK, Yi Zhang, Chen RW, CHRISTOPHER EBMEIER, Lachance C, Galloy M, Amelie Fradet-Turcotte, Martha Bulyk, Yawen Bai, Poirier MG, Jacques Cote, Akihiko Yokoyama, Tatiana Kutateladze. DOI 10.1038/s41467-023-36368-5

The MOZ-BRPF1 acetyltransferase complex in epigenetic crosstalk linked to gene regulation, development, and human diseases. Frontiers in cell and developmental biology, 2023/01/11. Viita T, Côté J. DOI 10.3389/fcell.2022.1115903

Characterization of multiple interactions between the envelope E protein of SARS-CoV-2 and human BRD4 STAR Protocols, 2022/12. Jacques Cote, Mohamad Zandian, Suk Min Jang, Catherine Lachance, Arpan Acharya, Siddappa N. Byrareddy, Jacques Côté, Tatiana Kutateladze. DOI 10.1016/j.xpro.2022.101853

A balancing act: interactions within NuA4/TIP60 regulate picNuA4 function in <i>Saccharomyces cerevisiae</i> and humans Genetics, 2022/11/01. Phoebe Y.T. Lu, Alyssa C Kirlin, Maria Aristizabal, Hilary Brewis, Nancy Lévesque, Dheva Setiaputra, Nikita Avvakumov, Joris Benschop, Groot Koerkamp MJA, Frank Holstege, Nevan Krogan, Calvin Yip, Jacques Cote, Michael Kobor. DOI 10.1093/genetics/iyac136

Oncogenic ZMYND11-MBTD1 fusion protein anchors the NuA4/TIP60 histone acetyltransferase complex to the coding region of active genes Cell Reports, 2022/06. Jacques Cote. DOI 10.1016/j.celrep.2022.110947

Binding of the SARS-CoV-2 envelope E protein to human BRD4 is essential for infection Structure, 2022/06. Jacques Cote. DOI 10.1016/j.str.2022.05.020

Recurrent chromosomal translocations in sarcomas create a megacomplex that mislocalizes NuA4/TIP60 to Polycomb target loci Genes & Development, 2022/06/01. Jacques Cote. DOI 10.1101/gad.348982.121

MRG proteins are shared by multiple protein complexes with distinct functions. Molecular & cellular proteomics : MCP, 2022/05/27. DOI 10.1016/j.mcpro.2022.100253

New insights into the DNA repair pathway choice with NuA4/TIP60. DNA repair, 2022/03/03. DOI 10.1016/j.dnarep.2022.103315

Rap1 regulates TIP60 function during fate transition between two-cell-like and pluripotent states. Genes & development, 2022/02/24. DOI 10.1101/gad.349039.121

NuA4 and H2A.Z control environmental responses and autotrophic growth in Arabidopsis Nature Communications, 2022/01. Jacques Cote. DOI 10.1038/s41467-021-27882-5

DNA damage-induced phosphorylation of histone H2A at serine 15 is linked to DNA end resection. Molecular and cellular biology, 2021/09/27. DOI 10.1128/mcb.00056-21

Antagonistic relationship of NuA4 with the non-homologous end-joining machinery at DNA damage sites PLOS Genetics, 2021/09/20. Salar Ahmad, Valérie Côté, Xue Cheng, Gaëlle Bourriquen, Vasileia Sapountzi, Mohammed Altaf, Jacques Côté. DOI 10.1371/journal.pgen.1009816

Approaches to Study Native Chromatin-Modifying Complex Activities and Functions Frontiers in Cell and Developmental Biology, 2021/09/16. DOI 10.3389/fcell.2021.729338

NuA4 and SAGA acetyltransferase complexes cooperate for repair of DNA breaks by homologous recombination PLOS Genetics, 2021/07/06. Xue Cheng, Valérie Côté, Jacques Côté. DOI 10.1371/journal.pgen.1009459

Structural and biophysical characterization of the nucleosome-binding PZP domain. STAR protocols, 2021/04/19. DOI 10.1016/j.xpro.2021.100479

NuA4 and SAGA acetyltransferase complexes cooperate for repair of DNA breaks by homologous recombination 2021/03/04. Xue Cheng, Valérie Côté, Jacques Côté. DOI 10.1101/2021.03.04.433861

DNA damage-induced phosphorylation of histone H2A at serine 15 is linked to DNA end resection 2021/02/09. Salar Ahmad, Valérie Côté, Jacques Côté. DOI 10.1101/2021.02.08.430376

Antagonistic relationship of NuA4 with the Non-Homologous End-Joining machinery at DNA damage sites 2021/01/29. Salar Ahmad, Valerie Côté, Xue Cheng, Gaëlle Bourriquen, Vasileia Sapountzi, Mohammed Altaf, Jacques Côté. DOI 10.1101/2021.01.29.428810

The deubiquitylase Ubp15 couples transcription to mRNA export eLife, 2020/11/23. Fanny Eyboulet, Célia Jeronimo, Jacques Côté, François Robert. DOI 10.7554/eLife.61264

De Novo KAT5 Variants Cause a Syndrome with Recognizable Facial Dysmorphisms, Cerebellar Atrophy, Sleep Disturbance, and Epilepsy The American Journal of Human Genetics, 2020/09. DOI 10.1016/j.ajhg.2020.08.002

The Deubiquitylase Ubp15 Couples Transcription to mRNA Export 2020/08/22. Fanny Eyboulet, Célia Jeronimo, Jacques Côté, François Robert. DOI 10.1101/2020.08.20.258822

JMJD6 participates in the maintenance of ribosomal DNA integrity in response to DNA damage PLOS Genetics, 2020/06/29. Jérémie Fages, Catherine Chailleux, Jonathan Humbert, Suk-Min Jang, Jérémy Loehr, Jean-Philippe Lambert, Jacques Côté, Didier Trouche, Yvan Canitrot. DOI 10.1371/journal.pgen.1008511

Structural Basis for EPC1-Mediated Recruitment of MBTD1 into the NuA4/TIP60 Acetyltransferase Complex Cell Reports, 2020/03. DOI 10.1016/j.celrep.2020.03.003

Integrated analysis of H2A.Z isoforms function reveals a complex interplay in gene regulation eLife, 2020/02/28. Assala Lamaa, Jonathan Humbert, Marion Aguirrebengoa, Xue Cheng, Estelle Nicolas, Jacques Côté, Didier Trouche. DOI 10.7554/eLife.53375

Molecular Basis for the PZP Domain of BRPF1 Association with Chromatin Structure, 2020/01. DOI 10.1016/j.str.2019.10.014

Gcn5 and Esa1 function as histone crotonyltransferases to regulate crotonylation-dependent transcription Journal of Biological Chemistry, 2019/12. Leonie Kollenstart, Anton J.L. de Groot, George M.C. Janssen, Xue Cheng, Kees Vreeken, Fabrizio Martino, Jacques Côté, Peter A. van Veelen, Haico van Attikum. DOI 10.1074/jbc.RA119.010302

Histone H3K23-specific acetylation by MORF is coupled to H3K14 acylation. Nature communications, 2019/10/17. DOI 10.1038/s41467-019-12551-5

Pre-existing H4K16ac levels in euchromatin drive DNA repair by homologous recombination in S-phase Communications Biology, 2019/07/05. Nobuo Horikoshi, Dharmendra Sharma, Fransisca Leonard, Raj K. Pandita, Vijaya K. Charaka, Shashank Hambarde, Nobuko T. Horikoshi, Puja Gaur Khaitan, Sharmistha Chakraborty, Jacques Cote, Biana Godin, Clayton R. Hunt, Tej K. Pandita. DOI 10.1038/s42003-019-0498-z

The Tumor Suppressor PALB2: Inside Out Trends in Biochemical Sciences, 2019. Ducy, M., Sesma-Sanz, L., Guitton-Sert, L., Lashgari, A., Gao, Y., Brahiti, N., Rodrigue, A., Margaillan, G., Caron, M.-C., Côté, J., Simard, J., Masson, J.-Y.. DOI 10.1016/j.tibs.2018.10.008

Measurement and Analysis of Lysine Acetylation by KAT Complexes In Vitro and In Vivo. Methods in molecular biology (Clifton, N.J.), 2019/01/01. DOI 10.1007/978-1-4939-9434-2_5