Répertoire du corps professoral

Végétalisation de perturbations minérales composées de particules fines dans la toundra du Bas-Arctique par des approches de restauration écologique
Programme: Subventions Alliance
Organisme(s) subventionnaire(s): Conseil de recherches en sciences naturelles et génie Canada
Type de financement: Subvention
Établissement tête: Université Laval
Du 31 juillet 2024 au 30 juillet 2027

Improving the understanding of one of the largest carbon stocks in the American tropics
Programme: Subventions Alliance - Internationale - Catalyseur
Organisme(s) subventionnaire(s): Conseil de recherches en sciences naturelles et génie Canada
Type de financement: Subvention
Établissement tête: Université Laval
Du 15 juillet 2024 au 14 juillet 2025

Élaboration d'une liste à jour des lichens du Québec (Macrolichens et microlichens) et proposition d'une première liste documentée des macrolichens susceptibles d'être désignés menacés ou vulnérables au Québec
Organisme(s) subventionnaire(s): Min. de l'environnement de la Lutte contre les changements climatiques de la Faune et des Parcs
Type de financement: Contrat
Établissement tête: Université Laval
Du 26 juin 2024 au 15 mars 2026

Accès et utilisation des données numériques relatives aux plantes vasculaires ayant servi au projet de la flore nordique du Québec et du Labrador et des données des plantes invasculaires de la collection de l'herbier Louis-Marie
Organisme(s) subventionnaire(s): Min. de l'environnement de la Lutte contre les changements climatiques de la Faune et des Parcs
Type de financement: Contrat
Établissement tête: Université Laval
Du 15 mai 2024 au 15 mars 2026

Exploring Antibiotic Resistance Dynamics in Lichen Woodlands
Programme: Fonds d'accélération de la recherche Sentinelle Nord
Organisme(s) subventionnaire(s): Secrétariat des programmes interorganismes à l’intention des établissements
Type de financement: Subvention
Établissement tête: Université Laval
Du 1 mars 2024 au 31 mars 2025

Soutien aux activités de recherche de l'Herbier Louis-Marie
Programme: BDR - Contributions
Organisme(s) subventionnaire(s): Université Laval - Fonds internes
Type de financement: Subvention
Établissement tête: Université Laval
Du 1 mai 2022 au 30 avril 2027

Centre d'études nordiques
Programme: Regroupements stratégiques NT
Organisme(s) subventionnaire(s): Université du Québec à Rimouski, Université Laval - Fonds internes, Université du Québec à Trois-Rivières, Université de Sherbrooke, Institut national de recherche scientifique (INRS), Fonds de recherche du Québec - Nature et technologies
Type de financement: Subvention
Établissement tête: Université Laval
Du 1 avril 2022 au 31 mars 2028

Ecogenomics of mining areas for sustainable Canadian North (GENOSCAN)
Programme: Sentinelle Nord - Deuxième appel à projets majeurs
Organisme(s) subventionnaire(s): Secrétariat des programmes interorganismes à l’intention des établissements
Type de financement: Subvention
Établissement tête: Université Laval
Du 1 novembre 2020 au 31 décembre 2024

Centre d'étude de la forêt
Programme: Regroupements stratégiques NT
Organisme(s) subventionnaire(s): Université Laval - Fonds internes, Fonds de recherche du Québec - Nature et technologies
Type de financement: Subvention
Établissement tête: Université du Québec à Montréal - UQAM
Du 1 avril 2019 au 31 mars 2026

Financements des 2 dernières années

FGR - Impact du feu sur la diverstié des bactéries et le flux des nutriments dans la pessière à lichens
Programme: Fonds général de recherche du CRSNG
Organisme(s) subventionnaire(s): Université Laval - Fonds internes
Type de financement: Subvention
Établissement tête: Université Laval
Du 10 juin 2023 au 9 juin 2024

Elucidating the evolutionary history of a cold-temperage moss group (Racomitrium sect. Racomitrium) using
Programme: Bourse de recherche Mitacs Globalink
Organisme(s) subventionnaire(s): MITACS Inc.
Type de financement: Subvention
Établissement tête: Université Laval
Du 17 octobre 2022 au 27 mars 2023

Mise en végétation écologique des sites miniers recouverts d’un matériau granulaire : Développement d'une méthode efficiente et peu coûteuse
Programme: Programme de recherche en partenariat sur le développement durable du secteur minier-II
Organisme(s) subventionnaire(s): Fonds de recherche du Québec - Nature et technologies
Type de financement: Subvention
Établissement tête: Université Laval
Du 27 juillet 2020 au 26 juillet 2023

Chaire de recherche, in genomics and metabolomics of the symbiosis between tropical plants and microbes
Programme: Fonds des leaders John-R.-Evans (FLJR)
Organisme(s) subventionnaire(s): Fondation Canadienne pour l'innovation (La), Ministère de l'éducation et de l'enseignement supérieur
Type de financement: Subvention
Établissement tête: Université Laval
Du 5 juin 2020 au 1 mai 2023

Chaire de recherche du Canada en in genomics and metabolomics of the symbiosis between tropical plants and microbes
Programme: Chaires de recherche du Canada - Fonctionnement
Organisme(s) subventionnaire(s): Conseil de recherches en sciences naturelles et génie Canada
Type de financement: Subvention
Établissement tête: Université Laval
Du 1 octobre 2019 au 30 septembre 2024

Determining critical thresholds of landscapte disturbance in coniferous and mixed boreal forests in western Quebec
Programme: Subvention de partenariat stratégique (SPS)
Organisme(s) subventionnaire(s): Produits forestiers Résolu, Conseil de recherches en sciences naturelles et génie Canada
Type de financement: Subvention
Établissement tête: Université du Québec en Abitibi-Témiscamingue - UQAT
Du 1 avril 2018 au 31 mars 2023

Spatial and temporal diversity of the bryophyte Arctic flora and associated cyanobacterial and fungal biota
Programme: Subventions à la découverte SD (individuelles et d'équipe)
Organisme(s) subventionnaire(s): Secrétariat Inter-Conseils (Canada) (CRSH, CRSNG, IRSC), Conseil de recherches en sciences naturelles et génie Canada
Type de financement: Subvention
Établissement tête: Université Laval
Du 1 avril 2016 au 31 mars 2023

Encadrements terminés dans les 5 dernières années

Loïc Jean-Cyril Soumila, Maîtrise en biologie - avec mémoire

Dennis Escolastico Ortiz, Doctorat en biologie

Flora Amill, Doctorat en biologie

Sandrine Toupin, Maîtrise en biologie - avec mémoire

Anthony Piot, Doctorat en sciences forestières

Publications des 5 dernières années

Two draft genomes of fungal leaf endophytes from tropical gymnosperms Microbiology Resource Announcements, 2024/11/12. Juan Carlos Villarreal Aguilar, Omayra Meléndez, Rita Bethancourt, Ariadna Bethancourt, Lilisbeth Rodríguez-Castro, Jorge Mendieta, Armando Durant, Marta Vargas, Brian Sedio, Kristin Saltonstall. DOI 10.1128/mra.00511-24

Leaf Endophytes Relationship with Host Metabolome Expression in Tropical Gymnosperms Journal of Chemical Ecology, 2024/11. Adriel M. Sierra, Omayra Meléndez, Rita Bethancourt, Ariadna Bethancourt, Lilisbeth Rodríguez-Castro, Christian A. López, Brian E. Sedio, Kristin Saltonstall, Juan Carlos Villarreal A.. DOI 10.1007/s10886-024-01511-z

Phaeoceros perpusillus var. scabrellus Suwanmala & Chantanaorr. 2024, var. nov. Zenodo, 2024/07/23. Orawanya Suwanmala, Juan Carlos Villarreal A., Fay-Wei Li, SAHUT CHANTANAORRAPINT. DOI 10.5281/zenodo.12802578

Phaeoceros perpusillus var. scabrellus Suwanmala & Chantanaorr. 2024, var. nov. Zenodo, 2024/07/23. Orawanya Suwanmala, Juan Carlos Villarreal A., Fay-Wei Li, SAHUT CHANTANAORRAPINT. DOI 10.5281/zenodo.12802579

Phaeoceros perpusillus var. scabrellus (Notothyladaceae, Anthocerotophyta), a new taxon from northern Thailand PhytoKeys, 2024/07/23. Orawanya Suwanmala, Juan Carlos Villarreal A., Fay-Wei Li, Sahut Chantanaorrapint. DOI 10.3897/phytokeys.244.124080

TWO DRAFT GENOMES OF FUNGAL leaf endophytes from tropical gymnosperms Zenodo, 2024/07/10. Juan Carlos Villarreal A.. DOI 10.5281/zenodo.12521996

TWO DRAFT GENOMES OF FUNGAL leaf endophytes from tropical gymnosperms Zenodo, 2024/07/10. Juan Carlos Villarreal A.. DOI 10.5281/zenodo.12521997

Diversity of symbiotic cyanobacteria in cycad coralloid roots using a short-read rbcL-X amplicon Symbiosis, 2024/03. Adriel M. Sierra, Sandrine Toupin, Marta Alonso-García, Juan Carlos Villarreal A.. DOI 10.1007/s13199-024-00972-w

New insights on cycad biology and evolution 2024/02/09. Shayla Salzman, melissa whitaker, Adriel Sierra, Daniel E. Bustos Díaz, Angélica Cibrián-Jaramillo, Yang Liu, Francisco Barona Gómez, Shouzhou Zhang, Sunil Sahu, Juan Carlos Villarreal A.. DOI 10.22541/au.170750032.26264089/v1

Panama says no to more mining — a win for environmentalists Nature, 2024/01/04. Juan Carlos Villarreal A., Nelva B. Villarreal, Luis F. De León. DOI 10.1038/d41586-023-04165-1

Differentially abundant bacteria drive the N2-fixation of a widespread moss in the forest-tundra transition zone 2023/06/16. Dennis Alejandro Escolástico-Ortiz, Charlotte Blasi, Jean-Philippe Bellenger, Nicolas Derome, Juan Carlos Villarreal-A. DOI 10.1101/2023.06.16.545342

Differentially abundant bacteria drive the N2-fixation of a widespread moss in the forest-tundra transition zone Symbiosis, 2023/06. Dennis Alejandro Escolástico-Ortiz, Charlotte Blasi, Jean-Philippe Bellenger, Nicolas Derome, Juan Carlos Villarreal-A. DOI 10.1007/s13199-023-00930-y

The consequences of mating system and dispersal potential on the genetic structure of leaf-inhabiting bryophyte metapopulations in a fragmented Amazonian landscape 2023/03/30. Adriel Sierra, Marta Alonso-Garcia, Charles Zartman, Juan Carlos Villarreal Aguilar. DOI 10.22541/au.168016508.89524249/v1

Differential Effects of Desiccation on Hornworts with Contrasting Life Histories in Tropical Montane Forests: A Functional Trait—Based Perspective Forests, 2023/01/29. Gabriel F. Peñaloza-Bojacá, Tiago Vilas-Boas, Juan C. Villarreal A, Adaíses S. Maciel-Silva. DOI 10.3390/f14020255

HISTORICAL BIOGEOGRAPHY OF THE AUSTRAL HORNWORT GENUS PHAEOMEGACEROS (DENDROCEROTACEAE, ANTHOCEROTOPHYTA) Bryophyte Diversity and Evolution, 2022/12/30. GABRIEL F. PEÑALOZA-BOJACÁ, ADRIEL M. SIERRA, HANNES BECHER, KAREN S. RENZAGLIA, JUAN CARLOS VILLARREAL A.. DOI 10.11646/bde.45.1.3

Bryophytes of mangroves of Bocas del Toro, Panama Bryophyte Diversity and Evolution, 2022/12/30. NORIS SALAZAR ALLEN, GREGORIO DAUPHIN, JUAN CARLOS VILLARREAL, CALEB CASWELL-LEVY, ERIN R. COX, BRYAN A. ESPINOZA P., JOSÉ GUDIÑO L., ENRIQUE HERNÁNDEZ-RODRÍGUEZ, KARLA Y. MAGAÑA-MARCIAL, ANNA MEZĂKA, JUAN DIEGO RAMÍREZ-ROMÁN, LILISBETH RODRÍGUEZ, ARIANTI ROJAS CARVAJAL, CAMILA ROMERO-MORENO, AKIKO TOMITANI, KATHERINE ZEBALLOS-GRIJALVA. DOI 10.11646/bde.45.1.9

Anthoceros genomes illuminate the origin of land plants and the unique biology of hornworts. Springer Science and Business Media LLC, 2021/04/27. Fay-Wei Li, Tomoaki Nishiyama, Manuel Waller, Eftychios Frangedakis, Jean Keller, Zheng Li, Noe Fernandez-Pozo, Michael Barker, Tom Bennett, Miguel Blazquez, Shifeng Cheng, Andrew Cuming, Jan de Vries, Sophie de Vries, Pierre-Marc Delaux, Issa S Diop, C Jill Harrison, Duncan Hauser, Jorge Hernández-García, Alexander Kirbis, John C Meeks, Isabel Monte, Sumanth Kumar Mutte, Anna Neubauer, Dietmar Quandt, Tanner Robison, Masaki Shimamura, Stefan A Rensing, Juan Carlos Villarreal A., Dolf Weijers, Susann Wicke, Gane Ka-Shu Wong, Keiko Sakakibara, Peter Szovenyi. DOI 10.17863/cam.68772

A target enrichment probe set for resolving the flagellate land plant tree of life Dryad, 2021/04/23. Jesse Breinholt, Sarah Carey, George Tiley, E. Christine Davis, Lorena Endara, Stuart McDaniel, Leandro Neves, Emily Sessa, Matt Von Konrat, Susan Fawcett, Stefanie M. Ickert-Bond, Paulo H. Labiak, Juan B. Larraín, Marcus Lehnert, Lily R. Lewis, Nathalie Nagalingum, Nikisha Patel, Stefan A. Rensing, Weston Testo, Alejandra Vasco, Juan Carlos Villarreal A., Evelyn Webb Williams, Gordon Burleigh, SAHUT CHANTANAORRAPINT, Leandro G. Neves, Matt Konrat, Stefanie Ickert-Bond. DOI 10.5061/dryad.7pvmcvdqg

Stigonema associated with boreal Stereocaulon possesses the alternative vanadium nitrogenase The Lichenologist, 2021/03. J. C. Villarreal A., M. Renaudin, A. Beaulieu-Laliberté, J. P. Bellenger. DOI 10.1017/S0024282921000062

Revisiting the early evolution of Cyanobacteria with a new thylakoid-less and deeply diverged isolate from a hornwort 2021/02/18. Nasim Rahmatpour, Duncan A. Hauser, Jessica M. Nelson, Pa Yu Chen, Juan Carlos Villarreal A., Ming-Yang Ho, Fay-Wei Li. DOI 10.1101/2021.02.18.431691

Geography, not host identity, shapes bacterial community in reindeer lichens 2021/01/31. Marta Alonso-García, Juan Carlos Villarreal A.. DOI 10.1101/2021.01.30.428927

Population genomics of a reindeer lichen species from North American lichen woodlands American Journal of Botany, 2021/01. Marta Alonso‐García, Felix Grewe, Serge Payette, Juan Carlos Villarreal A.. DOI 10.1002/ajb2.1601

DESCRIPCIÓN MORFOMÉTRICA DE DOS POBLACIONES DE Leiosporoceros dussii (STEPHANI) HÄSSEL (LEIOSPOROCEROTACEAE) DE PANAMÁ Tecnociencia, 2020/12/22. Y. Guadalupe, N. Flores, J. C. Villarreal. DOI 10.48204/j.tecno.v23n1a4

Specialized bacteriome uncovered in the coralloid roots of the epiphytic gymnosperm, Zamia pseudoparasitica Environmental DNA, 2020/10. Philip Bell‐Doyon, Jérôme Laroche, Kristin Saltonstall, Juan Carlos Villarreal Aguilar. DOI 10.1002/edn3.66

The Hornworts: Morphology, evolution and development New Phytologist, 2020/08/13. DOI 10.1111/nph.16874

Contrasting bacteriome of the hornwort Leiosporoceros dussii in two nearby sites with emphasis on the hornwort-cyanobacterial symbiosis Symbiosis, 2020/05/30. R. Bouchard, G. Peñaloza-Bojacá, S. Toupin, Y. Guadalupe, J. Gudiño, N. Salazar Allen, F. W. Li, J. C. Villarreal A.. DOI 10.1007/s13199-020-00680-1

Extremely low genetic diversity of Stigonema associated with Stereocaulon in eastern Canada The Bryologist, 2020/05/20. DOI 10.1639/0007-2745-123.2.188

Population Genomics and Phylogeography of a Clonal Bryophyte With Spatially Separated Sexes and Extreme Sex Ratios OpenAlex, 2020/05/08. Marta Alonso-García, Juan Carlos Villarreal A., Kenneth D. McFarland, Bernard Goffinet. DOI 10.60692/54p4e-gzf17

Population Genomics and Phylogeography of a Clonal Bryophyte With Spatially Separated Sexes and Extreme Sex Ratios OpenAlex, 2020/05/08. Marta Alonso-García, Juan Carlos Villarreal A., Kenneth D. McFarland, Bernard Goffinet. DOI 10.60692/g1ex2-jwt44

Population Genomics and Phylogeography of a Clonal Bryophyte With Spatially Separated Sexes and Extreme Sex Ratios Frontiers in Plant Science, 2020/05/08. DOI 10.3389/fpls.2020.00495

Extremely low genetic diversity in the European clade of the model bryophyte Anthoceros agrestis Dryad, 2020/02/24. Juan Carlos Villarreal A., Juan Carlos Villarreal A., Laura L Forrest. DOI 10.5061/dryad.qnk98sfcb

Specialized bacteriome uncovered in the coralloid roots of the epiphytic gymnosperm, Zamia pseudoparasitica OpenAlex, 2020/01/04. Philip Bell-Doyon, Jerome Laroche, Kristin Saltonstall, Juan Carlos Villarreal A.. DOI 10.60692/hz4s2-q8247

Specialized bacteriome uncovered in the coralloid roots of the epiphytic gymnosperm, Zamia pseudoparasitica OpenAlex, 2020/01/04. Philip Bell-Doyon, Jerome Laroche, Kristin Saltonstall, Juan Carlos Villarreal A.. DOI 10.60692/rs8bn-zvy37

One thousand plant transcriptomes and the phylogenomics of green plants Nature, 2019/10/23. DOI 10.1038/s41586-019-1693-2

Phylogenetic and morphological infrageneric classification of the genus Dendroceros (Dendrocerotaceae; Anthocerotophyta), with the addition of two new subgenera Systematics and Biodiversity, 2019/10/03. Gabriel Felipe Peñaloza-Bojacá, Juan Carlos Villarreal-Aguilar, Adaíses Simone Maciel-Silva. DOI 10.1080/14772000.2019.1682080

Complete Genomes of Symbiotic Cyanobacteria Clarify the Evolution of Vanadium-Nitrogenase OpenAlex, 2019/06/27. Jessica Nelson, Duncan Hauser, José A. Gudiño, Yessenia A Guadalupe, John C. Meeks, Noris Salazar Allen, Juan Carlos Villarreal A., Fay-Wei Li. DOI 10.60692/6cw1s-sxr07

Complete Genomes of Symbiotic Cyanobacteria Clarify the Evolution of Vanadium-Nitrogenase OpenAlex, 2019/06/27. Jessica Nelson, Duncan Hauser, José A. Gudiño, Yessenia A Guadalupe, John C. Meeks, Noris Salazar Allen, Juan Carlos Villarreal A., Fay-Wei Li. DOI 10.60692/dahe6-d0k70