Répertoire du corps professoral

Eluciding the microvascular origin and behavioral correlates of functional connectivity during aging
Programme: Futurs leaders canadiens de la recherche sur le cerveau
Organisme(s) subventionnaire(s): Brain Canada Foundation
Type de financement: Subvention
Établissement tête: Université Laval
Du 1 septembre 2024 au 31 août 2026

Centre d'optique, photonique et lasers
Programme: Regroupements stratégiques NT
Organisme(s) subventionnaire(s): École polytechnique de Montréal, Université du Québec à Trois-Rivières, École de technologie supérieure, Université de Sherbrooke, Université Concordia, Université Laval - Fonds internes, Institut national de recherche scientifique (INRS), Fonds de recherche du Québec - Nature et technologies, Université McGill
Type de financement: Subvention
Établissement tête: Université Laval
Du 1 avril 2024 au 31 mars 2030

Oxygenation mapping in brain tumors with qBOLD MRI
Organisme(s) subventionnaire(s): Fondation de l'Université Laval
Type de financement: Subvention
Établissement tête: Université Laval
Du 1 avril 2024 au 31 mars 2025

A multimodal imaging platform to quantify noradrenergic modulation of neurovascular activity in vivo
Programme: Nouvelles frontières en recherche
Organisme(s) subventionnaire(s): Secrétariat des programmes interorganismes à l’intention des établissements
Type de financement: Subvention
Établissement tête: Université Laval
Du 31 mars 2023 au 30 mars 2025

A multimodal imaging platform to quantify noradrenergic modulation of neurovascular activity in vivo (projet enfant)
Programme: Nouvelles frontières en recherche
Organisme(s) subventionnaire(s): Secrétariat des programmes interorganismes à l’intention des établissements
Type de financement: Subvention
Établissement tête: Université Laval
Du 31 mars 2023 au 30 mars 2025

Une fenêtre sur le cerveau : l'oxygénation et la perfusion comme biomarqueurs
Programme: Chercheur-boursier Juniors 1 et 2, Seniors
Organisme(s) subventionnaire(s): Fonds de recherche du Québec - Santé
Type de financement: Subvention
Établissement tête: Université Laval
Du 1 juillet 2021 au 30 avril 2026

une fenêtre sur le cerveau : l'oxygénation et la perfusion comme biomarqueurs
Programme: Établissement de jeunes chercheurs - Juniors 1
Organisme(s) subventionnaire(s): Fonds de recherche du Québec - Santé
Type de financement: Subvention
Établissement tête: Université Laval
Du 1 juillet 2021 au 30 juin 2025

Développent de méthodes d'imagerie multimodale vasculaire et de l'oxygénation
Programme: Subventions à la découverte SD (individuelles et d'équipe)
Organisme(s) subventionnaire(s): Secrétariat Inter-Conseils (Canada) (CRSH, CRSNG, IRSC), Conseil de recherches en sciences naturelles et génie Canada
Type de financement: Subvention
Établissement tête: Université Laval
Du 1 avril 2018 au 31 mars 2025

Financements des 2 dernières années

Neurovascular networks : a few framework for modelling structural and functional connectivity in aging mice
Programme: Futurs leaders canadiens de la recherche sur le cerveau
Organisme(s) subventionnaire(s): Brain Canada Foundation
Type de financement: Subvention
Établissement tête: Université Laval
Du 1 septembre 2022 au 31 août 2024

Jérémie Tanguay, Doctorat en physique

Encadrements terminés dans les 5 dernières années

Anaïs Parrot, Maîtrise en physique - physique médicale - avec mémoire

François Gaudreault, Maîtrise en physique - physique médicale - avec mémoire

Frédéric Dion, Maîtrise en physique - physique médicale - avec mémoire

Jean-Philippe Lévesque, Maîtrise en physique - physique médicale - avec mémoire

Micaël Carrier, Doctorat en neurosciences

Publications des 5 dernières années

Microvascular structure variability explains variance in fMRI functional connectivity bioRxiv, 2024. Gaudreault, F., Desjardins, M.. DOI 10.1101/2024.03.22.585979

Comparison of compartmental analytical BOLD fMRI models against Monte Carlo simulations performed over cortical micro-angiograms bioRxiv, 2024. Charest, J., Walsh, M., Genois, É., Sévigny, E., Schwarz, P.-O., Gagnon, L., Desjardins, M.. DOI 10.1101/2024.03.06.583728

Bone marrow-derived myeloid cells transiently colonize the brain during postnatal development and interact with glutamatergic synapses iScience, 2024. Carrier, M., Robert, M.-È., St-Pierre, M.-K., Ibáñez, F.G., Gonçalves de Andrade, E., Laroche, A., Picard, K., Vecchiarelli, H.A., Savage, J.C., Boilard, É., Desjardins, M., Tremblay, M.-È.. DOI 10.1016/j.isci.2024.110037

Behavioral as well as hippocampal transcriptomic and microglial responses differ across sexes in adult mouse offspring exposed to a dual genetic and environmental challenge Brain, Behavior, and Immunity, 2024. Carrier, M., Hui, C.W., Watters, V., Šimončičová, E., Picard, K., González Ibáñez, F., Vernoux, N., Droit, A., Desjardins, M., Tremblay, M.-È.. DOI 10.1016/j.bbi.2023.11.025

In Vivo Imaging of Neuronal Activity and Blood Vessels in AAV-Injected Mice Optics and the Brain in Proceedings Biophotonics Congress: Optics in the Life Sciences 2023, OMA, NTM, BODA, OMP, BRAIN 2023, 2023. Parrot, A., Guilbert, J., Girard-Collins, P., Desjardins, M.. DOI 10.1364/BRAIN.2023.BM4B.5

In Vivo Imaging of Neuronal Activity and Blood Vessels in AAV-Injected Mice Optics and the Brain, BRAIN 2023, 2023. Parrot, A., Guilbert, J., Girard-Collins, P., Desjardins, M..

Bone Marrow-Derived Myeloid Cells Colonize the Brain Parenchyma During Postnatal Development and Interact with Synapses in Mice Under Normal Physiological Conditions SSRN, 2023. Carrier, M., Robert, M.-È., St-Pierre, M.-K., Ibáñez, F.G., de Andrade, E.G., Savage, J.C., Desjardins, M., Tremblay, M.-È.. DOI 10.2139/ssrn.4608531

The implication of a diversity of non-neuronal cells in disorders affecting brain networks Frontiers in Cellular Neuroscience, 2022. Carrier, M., Dolhan, K., Bobotis, B.C., Desjardins, M., Tremblay, M.E.. DOI 10.3389/fncel.2022.1015556

Optical measurement of microvascular oxygenation and blood flow responses in awake mouse cortex during functional activation Journal of Cerebral Blood Flow and Metabolism, 2022. Şencan, İ., Esipova, T., Kılıç, K., Li, B., Desjardins, M., Yaseen, M.A., Wang, H., Porter, J.E., Kura, S., Fu, B., Secomb, T.W., Boas, D.A., Vinogradov, S.A., Devor, A., Sakadžić, S.. DOI 10.1177/0271678X20928011

Baseline oxygen consumption decreases with cortical depth PLoS Biology, 2022. Mächler, P., Fomin-Thunemann, N., Thunemann, M., Sætra, M.J., Desjardins, M., Kılıç, K., Amra, L.N., Martin, E.A., Chen, I.A., Şencan-Eğilmez, I., Li, B., Saisan, P., Jiang, J.X., Cheng, Q., Weldy, K.L., Boas, D.A., Buxton, R.B., Einevoll, G.T., Dale, A.M., Sakadžić, S., Devor, A.. DOI 10.1371/journal.pbio.3001440

Movement correction method for laser speckle contrast imaging of cerebral blood flow in cranial windows in rodents Journal of Biophotonics, 2022/01. Jérémie Guilbert, Michèle Desjardins. DOI 10.1002/jbio.202100218

Microscopic Quantification of Oxygen Consumption across Cortical Layers 2021/10/14. Philipp Mächler, Natalie Fomin-Thunemann, Martin Thunemann, Marte Julie Sætra, Michèle Desjardins, Kıvılcım Kılıç, Ikbal Şencan, Baoqiang Li, Payam Saisan, Qun Cheng, Kimberly L. Weldy, David A. Boas, Richard B. Buxton, Gaute T. Einevoll, Anders M. Dale, Sava Sakadžić, Anna Devor. DOI 10.1101/2021.10.13.464176

Structural and Functional Features of Developing Brain Capillaries, and Their Alteration in Schizophrenia Frontiers in Cellular Neuroscience, 2021. Carrier, M., Guilbert, J., Lévesque, J.-P., Tremblay, M.-È., Desjardins, M.. DOI 10.3389/fncel.2020.595002

Interactive database for 2-photon-based oxygen phosphorescence lifetime imaging data Optics InfoBase Conference Papers, 2021. Amra, L., Mächler, P., Fomin-Thunemann, N., Desjardins, M., Kilic, K., Saisan, P., Sencan, I., Li, B., Sakadžić, S., Devor, A., Thunemann, M..

Chronic Cranial Windows for Long Term Multimodal Neurovascular Imaging in Mice Frontiers in Physiology, 2021. Kılıç, K., Desjardins, M., Tang, J., Thunemann, M., Sunil, S., Erdener, Ş.E., Postnov, D.D., Boas, D.A., Devor, A.. DOI 10.3389/fphys.2020.612678

A suite of neurophotonic tools to underpin the contribution of internal brain states in fMRI Current Opinion in Biomedical Engineering, 2021. Mächler, P., Broggini, T., Mateo, C., Thunemann, M., Fomin-Thunemann, N., Doran, P.R., Sencan, I., Kilic, K., Desjardins, M., Uhlirova, H., Yaseen, M.A., Boas, D.A., Linninger, A.A., Vergassola, M., Yu, X., Lewis, L.D., Polimeni, J.R., Rosen, B.R., Sakadžić, S., Buxton, R.B., Lauritzen, M., Kleinfeld, D., Devor, A.. DOI 10.1016/j.cobme.2021.100273

Modeling of vascular space occupancy and BOLD functional MRI from first principles using real microvascular angiograms Magnetic Resonance in Medicine, 2021/01. Élie Genois, Louis Gagnon, Michèle Desjardins. DOI 10.1002/mrm.28429

Imaging the Neuroimmune Dynamics Across Space and Time Frontiers in Neuroscience, 2020. Carrier, M., Robert, M.-È., González Ibáñez, F., Desjardins, M., Tremblay, M.-È.. DOI 10.3389/fnins.2020.00903

Estimation of cortical oxygen metabolism in awake mice using two-photon imaging of oxyphor 2p Optics InfoBase Conference Papers, 2020. Fomin-Thunemann, N., Mächler, P., Sætra, M.J., Thunemann, M., Desjardins, M., Saisan, P., Sencan, I., Li, B., Vinogradov, S.A., Sakadžić, S., Dale, A.M., Einevoll, G.T., Devor, A.. DOI 10.1364/BRAIN.2020.BTu4C.5

More homogeneous capillary flow and oxygenation in deeper cortical layers correlate with increased oxygen extraction eLife, 2019. Li, B., Esipova, T.V., Sencan, I., Kılıç, K., Fu, B., Desjardins, M., Moeini, M., Kura, S., Yaseen, M.A., Lesage, F., Østergaard, L., Devor, A., Boas, D.A., Vinogradov, S.A., Sakadži Ć, S.. DOI 10.7554/eLife.42299

First principle modeling of simultaneous VASO and BOLD fMRI with two-photon microscopy for optimal quantification of CBV changes in humans Progress in Biomedical Optics and Imaging - Proceedings of SPIE, 2019. Genois, E., Gagnon, L., Guilbert, J., Sakadzik, S., Devor, A., Boas, D., Desjardins, M.. DOI 10.1117/12.2507463

Causality as a New Paradigm in Brain Science Biological Psychiatry: Cognitive Neuroscience and Neuroimaging, 2019. Desjardins, M.. DOI 10.1016/j.bpsc.2019.04.009

Awake Mouse Imaging: From Two-Photon Microscopy to Blood Oxygen Level–Dependent Functional Magnetic Resonance Imaging Biological Psychiatry: Cognitive Neuroscience and Neuroimaging, 2019. Desjardins, M., Kılıç, K., Thunemann, M., Mateo, C., Holland, D., Ferri, C.G.L., Cremonesi, J.A., Li, B., Cheng, Q., Weldy, K.L., Saisan, P.A., Kleinfeld, D., Komiyama, T., Liu, T.T., Bussell, R., Wong, E.C., Scadeng, M., Dunn, A.K., Boas, D.A., Sakadžić, S., Mandeville, J.B., Buxton, R.B., Dale, A.M., Devor, A.. DOI 10.1016/j.bpsc.2018.12.002